一种基于贝叶斯网络、整合患者与细胞系数据的癌症药物因果靶点发现框架

由 root 提交于 周二, 07/14/2026 - 10:47
当前癌症药物靶点发现方法面临两个关键局限:一是来源于细胞系的靶点难以有效转化到患者肿瘤中;二是缺乏对靶点优先排序背后调控机制的因果性解释。本文提出BayesTx(Bayesian Therapeutics target discovery,贝叶斯治疗靶点发现),这是一个贝叶斯网络框架,通过整合患者转录组学数据与细胞系数据,以识别癌症中的因果性治疗靶点。 BayesTx将两个数据域投射到由通路活性和转录因子活性构成的共享生物学空间中,学习各自领域特异的因果图,并通过加权边聚合与自助法一致性过滤对其进行合并。对一致性网络进行do-模拟后,可以量化每个转录因子对癌细胞存活率的因果效应。 将该框架应用于乳腺癌研究时,利用TCGA-BRCA(癌症基因组图谱乳腺癌队列)和DepMap(癌症依赖性图谱)数据集,框架根据预测的因果影响对47个转录因子进行了排序,并进一步通过基于调控子网络的传播推导出基因层面的靶点。排名靠前的转录因子(TF)靶点还得到了外部队列数据中的生存分析以及药物基因组学药物反应关联分析的独立支持。 总体而言,BayesTx表明,跨域贝叶斯网络建模能够连接患者数据与细胞系数据,从而系统性地识别癌症中的因果性治疗靶点。

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一种基于贝叶斯网络的整合患者与细胞系数据的癌症药物靶点因果发现框架

查看 ORCID 个人资料 Seok Hwan Yoon , 查看 ORCID 个人资料 Ye Rin Park , 查看 ORCID 个人资料 Hyun Uk Kim

doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.13.736676

Seok Hwan Yoon 1 KAIST(韩国科学技术院); 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议 提供。

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📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.13.736676v1?rss=1

🏷️ 癌症药物靶点 贝叶斯网络 因果推断 患者-细胞系整合 转录因子 乳腺癌