共享单倍型上一个被忽视的远端调控信号驱动了GBA1相关帕金森病基础上的神经炎症级联反应

root 提交于 周二, 07/14/2026 - 04:47
背景:GBA1编码变异可导致单基因高雪氏病,但其为何会对多基因帕金森病(PD)产生如此强的风险作用,这一持续存在的谜题至今仍未解决。在本研究中,我们试图阐明这一长期存在的悖论。 方法:利用帕金森病进展标志物倡议(Parkinson’s Progression Markers Initiative)资源,我们整合了来自散发性PD病例和对照的全基因组测序数据,以及在北欧和阿什肯纳兹犹太人群中与之匹配的转录组、表观基因组和脑脊液蛋白质组数据。祖源特异性的遗传图谱使我们能够将疾病定位与eQTL、pQTL及染色质结构进行精确整合,从而将遗传关联与分子机制联系起来;同时,进化遗传学分析解析了该区域的单倍型结构。 结果:我们鉴定出一个与PD相关的调控信号,其位于距GBA1 150千碱基处,并在所有分子数据集及两种祖源人群中均得到稳健重复。整合定位分析确定rs77268551-G为候选调控变异,我们进一步表明该变异位于一个延伸单倍型上,该单倍型同时携带导致高雪氏病的N370S等位基因。进化分析显示,导致高雪氏病的N370S等位基因受到近期正向选择作用的明确特征,从而形成了这一延伸的共享单倍型,并可能因此掩盖了潜在的远端PD相关调控信号。rs77268551-G位于一个神经元增强子内,该增强子具有与超级增强子活性一致的特征,可协调增强子—增强子—启动子之间的层级相互作用,作用于11个顺式靶基因,包括ADAR、IL6R和GBA1,驱动一个协调一致的转录程序。蛋白质组学分析鉴定出基因型特异性的脑脊液蛋白特征,包括PARK7、BIN1和SAA1,这与神经炎症程序一致。 结论:这些发现支持一种“双重打击”模型:其中,远端调控元件是驱动PD相关分子程序的主要因素,而位于同一单倍型上共同遗传的GBA1蛋白编码变异则对该调控变异所建立的风险进行修饰和放大,从而形成临床上独特的GBA1相关PD表型。调控激活与GBA1相关功能效应共同汇聚于神经炎症和溶酶体通路,而由此产生的分子特征提示了与基因型相关、具有潜在临床意义的生物标志物。

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一个位于共享单倍型上的、此前被忽视的远端调控信号驱动了GBA1相关帕金森病基础神经炎症级联反应

Rahel Feleke, Winston Lau, Philip Zahariev, Bethany Quinton, Alexander Hull, Kerri kinghorn, John Hardy, Dallas M Swallow, Toby Andrew, Nikolas Maniatis

doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.10.737850

Rahel Feleke 1 伦敦帝国理工学院,伦敦大学学院; 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 保留所有权利。未经许可不得转载。

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发布于 2026 年 7 月 13 日。

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Rahel Feleke , Winston Lau , Philip Zahariev , Bethany Quinton , Alexander Hull , Kerri kinghorn , John Hardy , Dallas M Swallow , Toby Andrew , Nikolas Maniatis

bioRxiv 2026.07.10.737850; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.10.737850

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共享单倍型上一个被忽视的远端调控信号驱动了 GBA1 相关帕金森病基础神经炎症级联反应

Rahel Feleke , Winston Lau , Philip Zahariev , Bethany Quinton , Alexander Hull , Kerri kinghorn , John Hardy , Dallas M Swallow , Toby Andrew , Nikolas Maniatis

bioRxiv 2026.07.10.737850; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.10.737850


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.10.737850v1?rss=1

🏷️ GBA1相关帕金森病 远端调控变异 共享单倍型 神经炎症 eQTL整合分析 溶酶体通路