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感染革兰氏阳性细菌的丝状噬菌体在很大程度上仍未得到探索。值得注意的是，在噬菌体丰富的乳制品生态系统中，迄今仅报道了两种感染弗氏丙酸杆菌（Propionibacterium freudenreichii）的丝状噬菌体，即B5和Philemon。尽管二者均已完成基因组学表征，但只有B5被证实为具有感染性的丝状单链DNA噬菌体。本研究旨在从瑞士型奶酪中分离并表征新的丝状噬菌体，以探究其多样性、结构特征、宿主特异性及其对乳制品环境的潜在适应性。 研究人员筛查了来自法国的30份生乳和巴氏杀菌乳奶酪样品，以检测感染P. freudenreichii菌株的噬菌体。共分离得到11株噬菌体，其中9株呈现丝状形态。这些丝状噬菌体被命名为MINOG1至MINOG9，其基因组特征表现出该形态类型的典型特征，包括较小的单链DNA基因组，以及按功能模块组织、呈共线排列的基因。与B5和Philemon相比，这些噬菌体的序列差异范围为0.1%至7%。这些噬菌体还表现出多样化的宿主范围。 为进一步探索噬菌体与P. freudenreichii之间的相互作用，我们对本研究所用菌株的基因组以及从NCBI数据库获取的其他基因组进行了筛查，以寻找预计靶向这些丝状噬菌体的CRISPR间隔序列。许多菌株含有CRISPR间隔序列，其与这些噬菌体基因组区域的同一性为79%至100%。尽管存在与噬菌体B5、MINOG1、MINOG2和MINOG8完全匹配的间隔序列-原间隔序列对应关系，两株P. freudenreichii菌株却表现出显著不同的噬菌体抗性水平。相反，若干菌株尽管缺乏靶向这些噬菌体的CRISPR间隔序列，却对几乎所有测试的噬菌体均具有抗性，这表明P. freudenreichii中可能还存在其他防御系统。
感染革兰氏阳性细菌的丝状噬菌体在很大程度上仍未得到充分探索。值得注意的是，在噬菌体资源丰富的乳制品生态系统中，迄今仅报道了两株感染弗氏丙酸杆菌（Propionibacterium freudenreichii）的丝状噬菌体，即B5和Philemon。尽管两者均已完成基因组学特征分析，但仅B5被证实为具有感染性的丝状单链DNA噬菌体。本研究旨在从瑞士型奶酪中分离并表征新的丝状噬菌体，以探究其多样性、结构特征、宿主特异性及其对乳制品环境的潜在适应性。
研究人员筛查了来自法国的30份生乳和巴氏杀菌乳奶酪样品，以检测感染P. freudenreichii菌株的噬菌体。共分离得到11株噬菌体，其中9株表现出丝状形态。这些丝状噬菌体被命名为MINOG1至MINOG9，其基因组特征符合该形态类型的典型特征，包括较小的单链DNA基因组，以及按功能模块组织、呈共线性排列的基因。与B5和Philemon相比，这些噬菌体表现出0.1%至7%的序列差异。它们还表现出多样化的宿主范围。
为进一步探究噬菌体与P. freudenreichii之间的相互作用，我们对本研究所用菌株的基因组以及从NCBI数据库获取的其他基因组进行了筛查，以寻找预测可靶向这些丝状噬菌体的CRISPR间隔序列。许多菌株含有与这些噬菌体基因组区域具有79%至100%同一性的CRISPR间隔序列。尽管与噬菌体B5、MINOG1、MINOG2和MINOG8存在完全匹配的间隔序列-原间隔序列对应关系，两株P. freudenreichii菌株却表现出显著不同的噬菌体抗性水平。相反，若干菌株尽管缺乏靶向这些噬菌体的CRISPR间隔序列，却对几乎所有测试噬菌体均表现出抗性，这表明P. freudenreichii中可能存在额外的防御系统。
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.11.737922v1?rss=1
🏷️ 丝状噬菌体 费氏丙酸杆菌 瑞士型奶酪 单链DNA病毒 CRISPR防御 宿主范围