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分子肿瘤委员会（molecular tumor board, MTB）是精准肿瘤学的核心，基于患者肿瘤的分子谱提供个体化治疗建议。基因组学对MTB至关重要，但其往往无法识别具有临床可操作性的靶点，而磷酸化蛋白质组学可以弥补这一缺口。我们提出了肿瘤蛋白质组活性状态（tumor proteome activity status, TOPAS）平台，这是一个端到端分析流程，可将TB级磷酸化蛋白质组学数据转换为用于MTB讨论的患者特异性报告，重点关注与致癌机制和治疗靶点相关的临床重要信号通路。该平台旨在适应不断扩大的队列规模，整合了1,998个肿瘤样本的数据，以支持患者层面和队列层面的假设生成。一个网络门户可执行质量控制、计算TOPAS评分、识别肿瘤抗原和免疫检查点，并提供差异蛋白丰度分析和离群值检测的交互式分析。TOPAS平台为开源平台，回应了一项关键的未满足需求，并有助于未来在精准肿瘤学中更广泛地应用磷酸化蛋白质组学。
TOPAS：用于分子肿瘤委员会的磷酸化蛋白质组数据分析与决策支持平台 | bioRxiv
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TOPAS：用于分子肿瘤委员会的磷酸化蛋白质组数据分析与决策支持平台
Cecilia Bang Jensen，Amirhossein Sakhteman，Firas Hamood，Annika Schneider，Julia Woortman，Maria-Veronica Teleanu，Peter Horak，Florian P. Bayer，Christoph Stange，Jennifer Huellein，Daniel Hübschmann，Anton G. Henssen，Stefan Fröhling，Bernhard Kuster，Matthew The
doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.08.737143
Cecilia Bang Jensen 1 慕尼黑工业大学生命科学学院，德国弗赖辛 85354； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。
该作品根据 CC-BY-NC 4.0 国际许可协议 提供。
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发布于 2026 年 7 月 13 日。
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Cecilia Bang Jensen，Amirhossein Sakhteman，Firas Hamood，Annika Schneider，Julia Woortman，Maria-Veronica Teleanu，Peter Horak，Florian P. Bayer，Christoph Stange，Jennifer Huellein，Daniel Hübschmann，Anton G. Henssen，Stefan Fröhling，Bernhard Kuster，Matthew The
bioRxiv 2026.07.08.737143； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.08.737143
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TOPAS：用于分子肿瘤委员会的磷酸化蛋白质组数据分析与决策支持平台
Cecilia Bang Jensen，Amirhossein Sakhteman，Firas Hamood，Annika Schneider，Julia Woortman，Maria-Veronica Teleanu，Peter Horak，Florian P. Bayer，Christoph Stange，Jennifer Huellein，Daniel Hübschmann，Anton G. Henssen，Stefan Fröhling，Bernhard Kuster，Matthew The
bioRxiv 2026.07.08.737143； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.08.737143
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.08.737143v1?rss=1
🏷️ 磷酸化蛋白质组学 精准肿瘤学 分子肿瘤委员会 决策支持平台 信号通路分析