ArthroVerse:节肢动物相关微生物组中蛋白质家族多样性的图谱绘制

由 root 提交于 周一, 07/13/2026 - 10:47
针对节肢动物相关微生物组的宏基因组研究已经产生了海量序列数据,然而这些蛋白质的功能与结构组织仍在很大程度上未被探索。在此,我们提出 ArthroVerse,这是首个来源于节肢动物相关宏基因组的蛋白质家族综合数据库。经过严格筛选、去冗余和聚类后,构建了非冗余蛋白质家族。进一步为这些蛋白质家族注释了微生物分类信息、宿主关联、蛋白质结构信息以及碳水化合物活性酶(CAZyme)预测。所得数据集整合了宏基因组来源蛋白质和参考基因组来源蛋白质,从而能够系统地探索昆虫微生物组中的功能多样性、进化关系以及宿主—微生物相互作用。ArthroVerse 为微生物生态学和节肢动物生理学研究提供了宝贵资源,并为认识昆虫相关微生物群落的蛋白质图景提供了前所未有的洞见。

pavlopoulos{at}fleming.gr

摘要

信息/历史

指标

预览 PDF

摘要

针对节肢动物相关微生物组的宏基因组研究已产生海量序列数据,然而这些蛋白质的功能与结构组织仍在很大程度上未被探索。在此,我们提出 ArthroVerse,这是首个来源于节肢动物相关宏基因组的综合性蛋白家族数据库。经过严格过滤、去冗余和聚类后,构建了非冗余蛋白家族。随后,进一步为这些蛋白家族标注了微生物分类信息、宿主关联、蛋白质结构信息以及碳水化合物活性酶(CAZyme)预测。所得数据集整合了宏基因组来源蛋白和参考基因组来源蛋白,从而能够系统性地探索昆虫微生物组中的功能多样性、进化关系以及宿主—微生物相互作用。ArthroVerse 为微生物生态学和节肢动物生理学研究提供了宝贵资源,并为昆虫相关微生物群落的蛋白质图谱提供了前所未有的洞见。

利益冲突声明

版权

持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。

本作品依据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议 提供。

返回顶部

上一篇

下一篇

发布于 2026 年 7 月 11 日。

下载 PDF

电子邮件

感谢您有意帮助传播 bioRxiv。

您的电子邮件 *

您的姓名 *

发送至 *

请输入多个地址,每行一个,或用逗号分隔。

您将要通过电子邮件发送以下内容

ArthroVerse:绘制节肢动物相关微生物组中的蛋白家族多样性图谱

消息主题

(您的姓名)已从 bioRxiv 转发一个页面给您

消息正文

(您的姓名)认为您可能希望查看 bioRxiv 网站上的此页面。

您的个人留言

验证码

此问题用于测试您是否为人类访问者,并防止自动化垃圾信息提交。

分享

ArthroVerse:绘制节肢动物相关微生物组中的蛋白家族多样性图谱

Iro N Chasapi , Eleni Aplakidou , Maria N Chasapi , Efthimia Lamari , Alexandros Galaras , Sophia Diplari , Ioannis Iliopoulos , Ioannis Z Emiris , Ilias Georgakopoulos-Soares , Solenn Patalano , Dimitrios J Stravopodis , Evangelos Karatzas , Fotis A Baltoumas , Nikos Kyrpides , Georgios A Pavlopoulos

bioRxiv 2026.07.11.737898;

doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.11.737898

分享本文:

复制

引文工具

ArthroVerse:绘制节肢动物相关微生物组中的蛋白家族多样性图谱

Iro N Chasapi , Eleni Aplakidou , Maria N Chasapi , Efthimia Lamari , Alexandros Galaras , Sophia Diplari , Ioannis Iliopoulos , Ioannis Z Emiris , Ilias Georgakopoulos-Soares , Solenn Patalano , Dimitrios J Stravopodis , Evangelos Karatzas , Fotis A Baltoumas , Nikos Kyrpides , Georgios A Pavlopoulos

bioRxiv 2026.07.11.737898;

doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.11.737898


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.11.737898v1?rss=1

🏷️ 节肢动物微生物组 宏基因组学 蛋白质家族 功能注释 CAZyme 宿主-微生物互作