转录连续谱连接了人类淋巴组织中的病毒负荷与宿主细胞生物学

人类免疫缺陷病毒（HIV-1）在淋巴组织中的持续存在仍然是实现治愈的主要障碍，然而，受感染细胞通常被表示为离散类别，这可能掩盖具有生物学意义的异质性。利用离体人扁桃体外植体模型以及对超过42,000个T细胞进行的单细胞RNA测序，我们表明，HIV转录跨越一个具有结构性的连续谱，并且病毒转录负荷可作为宿主细胞生物学的组织轴。沿这一连续谱，HIV转录的增加与免疫、炎症、代谢及氧化还原相关程序的协调性重塑相关。较低转录层级富集了先天免疫感知和炎性小体相关反应，而较高层级则表现出氧化磷酸化和氧化还原缓冲通路的激活。抗逆转录病毒治疗优先清除了转录活性较高的细胞群体，同时保留了较低和中间层级，从而导致这一连续谱被压缩而非被消除。总之，这些发现为解释人类淋巴组织内HIV转录异质性提供了一个定量框架，并提示持续性病毒活性反映的是宿主—病毒状态的一个谱系，而非单一的受感染细胞群体。通过将病毒转录负荷与不同的宿主细胞程序联系起来，这一框架或可为未来降低HIV持续存在及其相关炎症后果的策略提供依据。

人类免疫缺陷病毒（HIV-1）在淋巴组织中的持续存在仍然是实现治愈的主要障碍，但受感染细胞通常以离散类别加以表征，这可能掩盖具有生物学意义的异质性。利用离体人扁桃体外植体模型以及对超过42,000个T细胞进行单细胞RNA测序，我们表明HIV转录跨越一个具有结构性的连续谱，并且病毒转录负荷可作为宿主细胞生物学的组织轴。沿这一连续谱，HIV转录的增加与免疫、炎症、代谢及氧化还原相关程序的协调性重塑有关。较低转录层级富集了先天感知和炎性小体相关反应，而较高层级则表现出氧化磷酸化和氧化还原缓冲通路的激活。抗逆转录病毒治疗优先清除了转录活性较高的细胞群，同时保留了较低和中间层级，从而导致该连续谱被压缩而非消除。综上，这些发现为解释人类淋巴组织内HIV转录异质性提供了一个定量框架，并提示持续的病毒活性反映的是一系列宿主—病毒状态，而非单一的受感染细胞群体。通过将病毒转录负荷与不同的宿主细胞程序相联系，这一框架或可为未来降低HIV持续存在及其相关炎症后果的策略提供参考。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.07.736525v1?rss=1

🏷️ HIV-1持续感染 单细胞RNA测序 淋巴组织 转录异质性 宿主-病毒互作