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王氏树蜥(Calotes wangi)是一种广泛分布于中国南方和越南北部的鬣蜥科物种,表现出显著的体色变异以及快速的体色变化。尽管人们对体色变异基因组基础的兴趣日益增加,但鬣蜥科蜥蜴的染色体水平基因组资源仍然有限。在本研究中,我们利用 PacBio HiFi 测序和 Hi-C 挂载技术构建了 C. wangi 的染色体水平参考基因组。最终基因组组装大小约为 1.66 Gb,由 6 条大染色体和 11 条微染色体组成,contig N50 为 110.09 Mb,BUSCO 基因完整度达到 98.9%。共注释得到 20,442 个蛋白质编码基因。比较基因组分析鉴定出 297 个显著扩张的基因家族,其富集功能与类固醇代谢、染色质调控和表观遗传过程相关。该高质量基因组组装为未来开展鬣蜥科蜥蜴体色变异、表型可塑性及进化多样化研究提供了重要的基因组资源。
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.07.736949v1?rss=1
🏷️ 染色体水平基因组 王氏树蜥 体色变化 比较基因组学 基因家族扩张
来源出处
具有动态体色变化的王氏树蜥(Calotes wangi)染色体水平基因组组装
https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.07.736949v1?rss=1