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OLD 是前噬菌体 P2 的一种流产感染免疫蛋白，由一个 ABC ATP 酶传感器和一个 TO-PRIM 核酸酶效应器组成——这是一个大型蛋白家族共享的核心架构，该家族还包括抗噬菌体系统 Gabija、PARIS、Septu 和 Lamassu 的组分。OLD 最初因其在 recB 缺陷细胞中的致死性以及对噬菌体 {lambda} 感染的抑制作用而被鉴定出来，但调控其激活的机制一直未明。 在此，我们解析了失活状态下 OLD 四聚体的冷冻电镜结构，并表明其向二聚体形式的不稳定化会打开 TOPRIM 催化位点，从而刺激 tRNA 切割。这种活性会阻滞翻译，而该表型可被噬菌体编码的 tRNA 所挽救。我们证明，OLD 的激活并不严格依赖于 RecBCD：在 recB 缺陷细胞中，OLD 可结合异常 DNA 结构，但感染过程中的激活则需要识别噬菌体复制起点处的单链 DNA 发夹结构。总体而言，我们的研究结果揭示了宿主与噬菌体 DNA 加工因子如何共同构建一个调控 OLD 介导免疫的复杂图景。
OLD 哨兵：一种中止性感染型 tRNase 在 RecBCD 受损细胞中监测噬菌体复制与 DNA 缺陷 | bioRxiv
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OLD 哨兵：一种中止性感染型 tRNase 在 RecBCD 受损细胞中监测噬菌体复制与 DNA 缺陷
Anton Derzhaev，Jing Zhang，Alexey A. Gavrilov，Svetlana Belukhina，Aleksandr Shenfeld，Florence Depardieu，Baptiste Saudemont，Ilya Shamovsky，Vitaly Epshtein，Alina Demkina，Huaile Song，Olga Burenina，Mikhail Skutel，Maria Tikhomirova，Vadim Molodtsov，Konstantin Severinov，Evgeny Nudler，David Bikard，Chengyuan Wang，Artem Isaev
doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.10.737580
Anton Derzhaev 1 俄罗斯莫斯科生物与医学技术中心；
Jing Zhang 2 中国科学院上海药物研究所，中国上海；
Alexey A. Gavrilov 3 美国纽约州纽约市，纽约大学格罗斯曼医学院生物化学与分子药理学系；
Svetlana Belukhina 1 俄罗斯莫斯科生物与医学技术中心；
Aleksandr Shenfeld 1 俄罗斯莫斯科生物与医学技术中心；
Florence Depardieu 4 法国巴黎，巴斯德研究所，巴黎西岱大学，法国国家科学研究中心 UMR 3525，合成生物学实验室；
Baptiste Saudemont 4 法国巴黎，巴斯德研究所，巴黎西岱大学，法国国家科学研究中心 UMR 3525，合成生物学实验室；
Ilya Shamovsky 3 美国纽约州纽约市，纽约大学格罗斯曼医学院生物化学与分子药理学系；
Vitaly Epshtein 3 美国纽约州纽约市，纽约大学格罗斯曼医学院生物化学与分子药理学系；
Alina Demkina 1 俄罗斯莫斯科生物与医学技术中心；
Huaile Song 2 中国科学院上海药物研究所，中国上海；
Olga Burenina 1 俄罗斯莫斯科生物与医学技术中心；
Mikhail Skutel 1 俄罗斯莫斯科生物与医学技术中心；
Maria Tikhomirova 5 俄罗斯莫斯科，俄罗斯人民友谊大学分子与细胞医学研究所；
Vadim Molodtsov 5 俄罗斯莫斯科，俄罗斯人民友谊大学分子与细胞医学研究所；
Konstantin Severinov 6 俄罗斯科学院基因生物学研究所，俄罗斯莫斯科
Evgeny Nudler 3 美国纽约州纽约市，纽约大学格罗斯曼医学院生物化学与分子药理学系；
David Bikard 4 法国巴黎，巴斯德研究所，巴黎西岱大学，法国国家科学研究中心 UMR 3525，合成生物学实验室；
Chengyuan Wang 2 中国科学院上海药物研究所，中国上海；
Artem Isaev 1 俄罗斯莫斯科生物与医学技术中心；
通讯作者： artem.isaev{at}skoltech.ru
摘要
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摘要
OLD 是来源于前噬菌体 P2 的一种中止性感染免疫蛋白，由一个 ABC ATPase 传感模块和一个 TO-PRIM 核酸酶效应模块组成——这一核心结构架构广泛存在于一个大型蛋白家族中，包括抗噬菌体系统 Gabija、PARIS、Septu 和 Lamassu 的组成成分。OLD 最初因其在 recB 缺陷细胞中的致死性以及对 λ 噬菌体感染的抑制作用而被鉴定出来，但其激活机制迄今仍不清楚。在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议发布。
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发布于 2026 年 7 月 10 日。
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Anton Derzhaev，Jing Zhang，Alexey A. Gavrilov，Svetlana Belukhina，Aleksandr Shenfeld，Florence Depardieu，Baptiste Saudemont，Ilya Shamovsky，Vitaly Epshtein，Alina Demkina，Huaile Song，Olga Burenina，Mikhail Skutel，Maria Tikhomirova，Vadim Molodtsov，Konstantin Severinov，Evgeny Nudler，David Bikard，Chengyuan Wang，Artem Isaev
bioRxiv 2026.07.10.737580； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.10.737580
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Anton Derzhaev，Jing Zhang，Alexey A. Gavrilov，Svetlana Belukhina，Aleksandr Shenfeld，Florence Depardieu，Baptiste Saudemont，Ilya Shamovsky，Vitaly Epshtein，Alina Demkina，Huaile Song，Olga Burenina，Mikhail Skutel，Maria Tikhomirova，Vadim Molodtsov，Konstantin Severinov，Evgeny Nudler，David Bikard，Chengyuan Wang，Artem Isaev
bioRxiv 2026.07.10.737580； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.10.737580
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.10.737580v1?rss=1
🏷️ 抗噬菌体免疫 RecBCD tRNA切割酶 冷冻电镜 DNA损伤感知