大肠杆菌中前体rRNA的单细胞分析表明,YbeX和YbeY蛋白在核糖体生物发生中具有不同的作用途径

root 提交于 周六, 07/11/2026 - 12:47
大肠杆菌蛋白YbeX/CorC与核糖体生物发生因子YbeY编码于同一操纵子中,并且在镁限制条件下,删除ybeX会导致17S前体rRNA以及16S rRNA降解中间体的积累。为进一步研究ybeX缺失表型,我们采用了rRNA荧光原位杂交结合流式细胞术(rRNA-FISH-flow),以单细胞分辨率定量分析ΔybeX和ΔybeY菌株中16S rRNA、23S rRNA和17S前体rRNA的水平。 在限制性Mg2+条件下生长的ΔybeX细胞,在向稳定期过渡过程中,其17S前体rRNA含量表现出显著的细胞间异质性,单个细胞之间的差异最高可达25倍。从稳定期重新生长时,ΔybeX培养物表现出17S前体rRNA的双峰分布,揭示出两个不同的亚群体——一个保留高水平未加工前体rRNA,另一个则具有低水平前体rRNA——且在可见生长恢复之前,这两个亚群体的相对比例会随时间发生变化。两种菌株中成熟16S与23S rRNA之间的化学计量关系均保持紧密,表明这种异质性特异性地存在于前体rRNA加工过程,而非核糖体稳态的普遍性紊乱。ΔybeY突变体在细胞间更为均一地积累17S前体rRNA,且主要发生在富营养培养基中的指数生长期,这与其在16S rRNA成熟中的直接作用相一致。这些单细胞数据表明,YbeX和YbeY通过不同机制影响核糖体RNA代谢,并且ΔybeX延长的迟滞期是由单个细胞中前核糖体中间体的不均一清除所导致的。

大肠杆菌中 pre-rRNA 的单细胞分析表明,YbeX 和 YbeY 蛋白在核糖体生物发生中具有不同的作用途径 | bioRxiv

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大肠杆菌中 pre-rRNA 的单细胞分析表明,YbeX 和 YbeY 蛋白在核糖体生物发生中具有不同的作用途径

Abbas Mansour,Ismail Sarigul,Tanel Tenson,Ulo Maivali

doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.10.737703

Abbas Mansour

1 塔尔图大学技术研究所; 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。

本文依据 CC-BY 4.0 国际许可协议 提供。

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发布于 2026 年 7 月 10 日。

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Abbas Mansour,Ismail Sarigul,Tanel Tenson,Ulo Maivali

bioRxiv 2026.07.10.737703; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.10.737703

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大肠杆菌中 pre-rRNA 的单细胞分析表明,YbeX 和 YbeY 蛋白在核糖体生物发生中具有不同的作用途径

Abbas Mansour,Ismail Sarigul,Tanel Tenson,Ulo Maivali

bioRxiv 2026.07.10.737703; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.10.737703


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.10.737703v1?rss=1

🏷️ 大肠杆菌 核糖体生物发生 前体rRNA加工 单细胞分析 rRNA-FISH-flow YbeX/YbeY