一类RRM-1 RNA结合蛋白家族赋予拟杆菌属冷适应性和环境韧性

细菌利用转录后调控机制在环境变化过程中快速调整基因表达。在肠道相关属拟杆菌属（Bacteroides）中，由于这些生物缺乏诸如 Hfq 和 CsrA 这类典型 RNA 伴侣蛋白——而这些蛋白在许多研究深入的模式细菌中负责协调转录后应激反应——因此相关机制仍知之甚少。大多数拟杆菌都具有保守的、含 RNA 识别基序-1（RRM-1）结构域的 RNA 结合蛋白（这类蛋白在真核生物中比在细菌中更为常见），其被认为可作为全局性 RNA 伴侣蛋白发挥作用。在本文中，我们表明这些 RNA 结合蛋白（RBP）是冷应激适应的核心因子。与此同时删除所有 rbp 基因会在多个拟杆菌物种中产生冷敏感生长缺陷，而单个基因缺失则不会，从而揭示了保守的功能冗余性。温度骤降后，RBP 的转录本和蛋白迅速积累，而 RBP 的缺失会广泛重编程转录组。 拟杆菌 rbp 突变体的冷敏感性并非由核糖体组装或 rRNA 成熟缺陷引起。相反，我们发现，在多形拟杆菌（Bacteroides thetaiotaomicron）中，RBP 与 BT1884 协同作用，后者是该生物所拥有的唯一典型冷休克蛋白。RBP 和 BT1884 的联合缺失会产生一种合成性的严重冷敏感表型，从而界定了两个分别属于不相关蛋白家族、但在功能上冗余的冷应激系统。缺失 RBP 的菌株在同时受到低温和氧应激条件下存活率降低，而这正是拟杆菌细胞在宿主间传播过程中预期会遭遇的环境条件。综上所述，这些发现确立了 RRM-1 型 RBP 作为非典型冷休克蛋白的地位，它们使拟杆菌能够实现冷适应和环境存活，并提示了这些生物如何耐受宿主间传播过程中的应激。

RRM-1 RNA结合蛋白家族赋予拟杆菌属的冷适应能力与环境韧性 | bioRxiv

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拟杆菌属中的一类RRM-1 RNA结合蛋白赋予冷适应能力与环境韧性

Hyelan Lee， Anubhav Basu， Carin K Vanderpool

doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.07.737135

Hyelan Lee 1 伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校；

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发布于 2026年7月8日。

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拟杆菌属中的一类RRM-1 RNA结合蛋白赋予冷适应能力与环境韧性

Hyelan Lee， Anubhav Basu， Carin K Vanderpool

bioRxiv 2026.07.07.737135； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.07.737135

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拟杆菌属中的一类RRM-1 RNA结合蛋白赋予冷适应能力与环境韧性

Hyelan Lee， Anubhav Basu， Carin K Vanderpool

bioRxiv 2026.07.07.737135； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.07.737135

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.07.737135v1?rss=1

🏷️ 拟杆菌属 RNA结合蛋白 RRM-1结构域 冷应激适应 功能冗余 转录后调控