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葡萄粉蚧（Planococcus ficus）是一种在全球范围内具有入侵性的葡萄害虫，也是卷叶病毒的传播媒介。与其他粉蚧类似，其通过父源基因组消除进行繁殖；这是一种不依赖性染色体的性别决定系统，并与极端的两性异形相关。为表征该物种的基因组组织及性别偏倚表达，我们构建了一个基于长读长测序的参考基因组，长度为369 Mb，注释基因23,489个，并且与柑橘粉蚧（Planococcus citri）之间保留了宏观共线性。对来自加利福尼亚野外种群的4个个体进行重测序后，我们获得了该物种首个全基因组范围的核苷酸多样性估计值，并开发出132个用于种群监测的微卫星标记。在2,129个候选分泌蛋白中，存在一个与P. citri共享的保守核心，但每个物种均携带一组不同的谱系特异性效应子。 通过比较成体雄性和雌性的转录组，我们发现性别偏倚表达广泛存在且偏向雌性：在被检测的基因中，41%在两性之间存在差异表达，其中雌性偏倚基因不仅数量更多，而且倍数变化幅度更大。这些雌性偏倚基因并非随机分布，而是集中于由串联重复基因家族构成的、协同表达的离散区块中；这种模式此前尚未在粉蚧中被描述。雄性偏倚和雌性偏倚的分泌蛋白在来源上也存在差异：雄性偏倚蛋白来源于与P. citri共享的保守蛋白库，而雌性偏倚蛋白则覆盖了一个更具谱系特异性的蛋白库。总体而言，这些结果揭示了在缺乏性染色体的粉蚧中，性别偏倚表达呈现出偏向雌性且具有空间聚集性的结构特征，并为防控一种入侵性葡萄园害虫提供了基因组学资源。
葡萄粉蚧 Planococcus ficus 中广泛性别偏向基因表达的基因组区室化 | bioRxiv
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葡萄粉蚧 Planococcus ficus 中广泛性别偏向基因表达的基因组区室化
查看 ORCID 个人资料 Dario Cantu， 查看 ORCID 个人资料 Rosa Figueroa-Balderas， Mark Sisterson， Andrea Minio， 查看 ORCID 个人资料 Noe Cochetel， Rachel Naegele， Lindsey Burbank
doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.01.735863
Dario Cantu 1 加利福尼亚大学戴维斯分校； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 保留所有权利。未经许可不得重复使用。
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发表于 2026 年 7 月 7 日。
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引文工具 葡萄粉蚧 Planococcus ficus 中广泛性别偏向基因表达的基因组区室化 Dario Cantu， Rosa Figueroa-Balderas， Mark Sisterson， Andrea Minio， Noe Cochetel， Rachel Naegele， Lindsey Burbank bioRxiv 2026.07.01.735863； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.01.735863
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.01.735863v1?rss=1
🏷️ 粉蚧基因组 性别偏向表达 基因组区室化 父源基因组消除 比较转录组