LsGCRPred：基于lncRNA-SNP调控基因表达的乳腺癌和卵巢癌风险预测模型

长链非编码RNA（lncRNA）及其内部的单核苷酸多态性（SNP）在癌症易感性和疾病结局中发挥着关键作用。乳腺癌和卵巢癌具有遗传异质性，其精准诊断和治疗面临重大挑战。尽管个体化医疗近年来取得了进展，但将lncRNA-SNP（LSNP）标志物纳入癌症风险检测面板的应用仍然有限。在本研究中，我们提出了基于lncRNA-SNP调控基因表达的乳腺癌和卵巢癌风险预测模型LsGCRPred（LSNP-Gene Interaction Based Cancer Risk Prediction Model，基于LSNP-基因相互作用的癌症风险预测模型）。值得注意的是，我们的方法既考虑了lncRNA的组织特异性，也兼顾了其对具有易感条件个体的潜在益处。此外，通路分析表明，LSNP相互作用基因参与了关键的癌症调控通路。采用TaqMan基因分型和qPCR对所筛选LSNP在卵巢癌和乳腺癌细胞系中的存在进行了验证，同时证实了相关lncRNA及其关联基因转录本的显著表达。这些发现凸显了此前被忽视的lncRNA位点内遗传变异及其对疾病结局的调控影响，为个体化癌症诊断和治疗策略提供了新的见解。工具LsGCRPred可作为独立版本在GitHub上获取。GitHub链接：https://github.com/zglabDIB/LsGCRPred

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LsGCRPred：基于lncRNA-SNP调控基因表达的乳腺癌和卵巢癌风险预测模型

Troyee Das， Gourab Das， Byapti Ghosh， 查看 ORCID 个人资料 ZHUMUR GHOSH

doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.07.736696

Troyee Das Bose Institute 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予bioRxiv永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY-NC 4.0 国际许可协议公开提供。

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发布于 2026年7月7日。

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Troyee Das， Gourab Das， Byapti Ghosh， ZHUMUR GHOSH

bioRxiv 2026.07.07.736696； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.07.736696

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Troyee Das， Gourab Das， Byapti Ghosh， ZHUMUR GHOSH

bioRxiv 2026.07.07.736696； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.07.736696

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.07.736696v1?rss=1

🏷️ lncRNA-SNP 癌症风险预测 乳腺癌 卵巢癌 基因表达调控 个体化医疗