首届病毒分类自动化社区挑战赛

root 提交于 周二, 07/07/2026 - 18:47
病毒发现速度的迅猛增长使得由分类学专家进行人工整理日益变得不切实际,因此亟需可靠的软件,能够以可重复的方式在病毒分类学的全部十五个等级上将病毒contig归入相应分类单元。我们牵头组织了一项面向病毒计算分类学分类的开放社区挑战赛,并构建了一个结合专家人工整理序列与宏基因组序列的病毒序列数据集。共有17个团队贡献了总计34条自动化且完全可重复的分类流程。大多数工具能够正确归类属于已建立种、属或科的病毒,但在这些较低等级上尚未分类的病毒仍然具有挑战性。本研究提供了用于评测病毒计算分类学分类的数据集、开源软件、新方法和建议,并为对大规模组学数据中发现的大量病毒进行系统整理提供支持。

病毒发现速度的迅猛增长,使得由分类学专家进行人工整理日益不切实际,因此亟需可靠的软件,能够以可复现的方式在病毒分类体系全部十五个分类等级上将病毒contig归入相应类群。我们牵头发起了一项面向病毒计算分类学分类的开放社区挑战赛,并构建了一个结合专家整理序列与宏基因组序列的病毒序列数据集。共有17个团队贡献了总计34条自动化、完全可复现的分类流程。大多数工具能够正确归类属于已建立种、属或科的病毒,但在这些较低分类等级上尚未分类的病毒仍然具有挑战性。本研究提供了用于评测病毒计算分类学分类的数据集、开源软件、新方法和建议,并支持对大规模组学数据中发现的大量病毒进行组织归类。

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📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.04.736517v1?rss=1

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