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在单颗粒冷冻电镜中,连续构象异质性的分析始终具有挑战性。线性方法和基于深度学习的方法都将构象异质性视为对共识平均构象的扰动,这限制了它们分析大尺度蛋白质运动的能力。尽管经典的构象分类方法能够处理大的结构域运动,但它们会将连续的蛋白质动力学划分为离散的静态亚状态。在此,我们提出 cryoROLE,这是一种计算工具,可从通过多体精修构建的静态复合密度图中提取其中蕴含的连续构象动力学,并将其表示为运动结构域之间相对取向的构象景观。该景观以实空间形式呈现,可对结构域运动以及构象空间中各姿态的群体分布进行直观解释。将其应用于多种生物系统表明,该方法能够揭示与蛋白质功能相关的隐藏构象动力学。
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霍华德·休斯医学研究所,加利福尼亚大学旧金山分校生物化学与生物物理学系
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发布于 2026 年 7 月 4 日。
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CryoROLE:在单颗粒冷冻电镜中描述大尺度结构域间旋转
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CryoROLE:在单颗粒冷冻电镜中描述大尺度结构域间旋转
Chengmin Li, Wooyoung Choi, Hao Wu, Yifan Cheng
bioRxiv 2026.07.04.736454; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.04.736454
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CryoROLE:在单颗粒冷冻电镜中描述大尺度结构域间旋转
Chengmin Li, Wooyoung Choi, Hao Wu, Yifan Cheng
bioRxiv 2026.07.04.736454; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.04.736454
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.04.736454v1?rss=1
🏷️ 冷冻电镜 单颗粒分析 构象异质性 结构域旋转 蛋白质动力学 多体精修
来源出处
CryoROLE:表征单颗粒冷冻电镜中的大尺度结构域间旋转
https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.04.736454v1?rss=1