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糖胺聚糖(glycosaminoglycans, GAGs)是一类线性、带负电荷的多糖,能够介导与蛋白质之间种类广泛且具有关键生物学意义的相互作用,是生长因子信号传导、细胞外基质组装以及众多疾病过程的基础。然而,GAG-蛋白质相互作用迄今仍缺乏充分表征,部分原因在于缺少能够在整个GAG相互作用组范围内系统分析结合特征的高通量工具。 本文提出了一种新型基于表面等离子体共振(Surface Plasmon Resonance, SPR)的阵列方法,该方法利用16种常见来源的GAG制备物(包括硫酸软骨素(chondroitin sulphate, CS)、硫酸皮肤素(dermatan sulphate, DS)、硫酸乙酰肝素、肝素、透明质酸和角质素硫酸),从而能够测定GAG结合蛋白的特异性和亲和力。作为原理验证,我们采用4种已确立的GAG结合蛋白(抗凝血酶III、CD44、来源于inter-α-inhibitor的重链1以及Slit2)对该阵列进行了验证,所得数据与已知结合特异性一致,并对其中许多相互作用的亲和力进行了定量。该阵列还揭示了此前尚未报道的GAG相互作用,包括Slit2与CS及DS的结合,以及CD44与硫酸软骨素E的结合。
基于高通量SPR阵列的糖胺聚糖-蛋白质相互作用定量谱分析 | bioRxiv
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基于高通量SPR阵列的糖胺聚糖-蛋白质相互作用定量谱分析
Thomas A Jowitt Holly L Birchenough Jonathan F Popplewell Douglas Philip Dyer Anthony J Day
doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.02.736113
Thomas A Jowitt 1 曼彻斯特大学; 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方,其已授予bioRxiv永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY 4.0 国际许可协议公开提供。
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发布于 2026年7月4日。
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Thomas A Jowitt Holly L Birchenough Jonathan F Popplewell Douglas Philip Dyer Anthony J Day
bioRxiv 2026.07.02.736113; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.02.736113
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基于高通量SPR阵列的糖胺聚糖-蛋白质相互作用定量谱分析
Thomas A Jowitt Holly L Birchenough Jonathan F Popplewell Douglas Philip Dyer Anthony J Day
bioRxiv 2026.07.02.736113; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.02.736113
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.02.736113v1?rss=1
🏷️ 糖胺聚糖 蛋白质相互作用 表面等离子体共振 高通量阵列 结合亲和力