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体积电子显微镜(EM)已成为生成脑组织高分辨率重建结果的关键方法。随着 EM 体积数据规模的增大,在重建流程中使用自动图像分割已变得不可或缺,尽管这一过程会产生需要纠正的错误。此后,对这些错误进行校对和修正已成为该流程中的主要成本驱动因素,但要精确估计为支持对重建神经元网络进行有意义的科学分析所需的充分校对编辑次数,仍然是一项挑战。 我们提出了一种快速且计算成本低廉的方法,用于在无需事先掌握真实值的情况下估计连接组学校对工作的进展。我们表明,随着校对编辑次数的增加,简单的全局图不变量会以可预测的方式收敛到渐近极限,从而为校对完整性的定量“停笔”标准提供依据。我们在处于不同校对进展阶段的两个数据集上展示了该方法:斑马鱼脊髓数据集和 hemibrain 黑腹果蝇数据集。我们的方法降低了与校对活动规划和优先级排序相关的不确定性,并使数据所有者能够准确预测并预算为其科学问题所必需的校对工作量。
连接组质量以可预测的方式收敛,从而揭示校对过程中的最优停止点 | bioRxiv
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连接组质量以可预测的方式收敛,从而揭示校对过程中的最优停止点
Hannah Martinez, Jordan Matelsky, Daniel Xenes, Katharine Merfeld, Cara Cavanaugh, Patricia Rivlin, Cody J. Smith, Brock Wester
doi: https://doi.org/10.64898/2026.06.30.735414
Hannah Martinez 1 约翰斯·霍普金斯应用物理实验室; 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方,后者已授予 bioRxiv 许可,以永久展示该预印本。 本文依据 CC-BY 4.0 国际许可协议提供。
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发表于 2026 年 7 月 4 日。
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连接组质量以可预测的方式收敛,从而揭示校对过程中的最优停止点
Hannah Martinez, Jordan Matelsky, Daniel Xenes, Katharine Merfeld, Cara Cavanaugh, Patricia Rivlin, Cody J. Smith, Brock Wester
bioRxiv 2026.06.30.735414; doi: https://doi.org/10.64898/2026.06.30.735414
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连接组质量以可预测的方式收敛,从而揭示校对过程中的最优停止点
Hannah Martinez, Jordan Matelsky, Daniel Xenes, Katharine Merfeld, Cara Cavanaugh, Patricia Rivlin, Cody J. Smith, Brock Wester
bioRxiv 2026.06.30.735414; doi: https://doi.org/10.64898/2026.06.30.735414
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.30.735414v1?rss=1
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