ViralEpiBase:病毒RNA基因组及病毒编码转录本中表观转录组修饰位点的人工整理数据库

root 提交于 周六, 07/04/2026 - 14:47
RNA 的转录后化学修饰统称为表观转录组,现已成为调控病毒复制、致病性以及宿主—病毒相互作用的关键调控层。尽管有关病毒 RNA 修饰的实验数据正在迅速积累,但此前尚不存在一个专门且可自由获取的资源,用于系统整理不同病毒物种中的这些修饰位点。 在此,我们提出 ViralEpiBase,这是一个经人工整理的数据库,收录了在病毒 RNA 基因组和病毒编码转录本中以单核苷酸分辨率鉴定的表观转录组修饰位点。ViralEpiBase 目前整合了七种化学性质不同的 RNA 修饰类型:N6-甲基腺苷(m6A)、N1-甲基腺苷(m1A)、假尿苷(Ψ)、5-甲基胞苷(m5C)、2'-O-甲基化(2'OMe)、次黄苷以及 N4-乙酰胞苷(ac4C);涵盖 12 种具有临床和生物学意义的病毒物种,包括 DNA 病毒和 RNA 病毒。数据库中的每条记录均链接至其原始文献来源或已提交的数据集,并可按修饰类型、基因组坐标或病毒分类信息进行检索。 该数据库可通过直观的网页界面免费访问,并会随着新的实验证据不断出现而持续更新。因此,ViralEpiBase 提供了首个专门面向病毒表观转录组学的统一平台,旨在促进对 RNA 修饰在病毒生物学中功能机制的研究。

ViralEpiBase:一个人工整理的病毒RNA基因组及病毒编码转录持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。

本文依据 CC-BY 4.0 国际许可协议发布。

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发布于 2026 年 7 月 3 日。

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ViralEpiBase:一个人工整理的病毒RNA基因组及病毒编码转录本中表转录组修饰位点资源库

Sreeram Srinivasan,

Ajit Chande

bioRxiv

2026.07.02.735974;

doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.02.735974

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ViralEpiBase:一个人工整理的病毒RNA基因组及病毒编码转录本中表转录组修饰位点资源库

Sreeram Srinivasan,

Ajit Chande

bioRxiv

2026.07.02.735974;

doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.02.735974


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.02.735974v1?rss=1

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