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对淡水蜆属（Corbicula）的全球研究常常受到入侵性雄核生殖谱系的干扰，这些谱系会发生线粒体DNA捕获并进行克隆扩增。相比之下，苏拉威西古湖特有的蜆属类群进行有性生殖，因此为线粒体群体遗传学提供了一个独特且高度可靠的研究系统。本研究利用细胞色素c氧化酶亚基I（COI）标记，首次为两种特有种——波索湖的Corbicula possoensis和林杜湖的C. linduensis——建立了群体遗传学研究框架。我们分析了90条新获得的COI序列，来源于C. possoensis（6个采样点）和C. linduensis（3个采样点），并结合GenBank中的参考序列，以评估其遗传多样性、群体结构和系统地理格局。 分层AMOVA显示，两湖之间存在显著而深刻的分化（Φ_CT = 0.607），这与长期独立隔离的情形一致，而非源于一次共同的地理隔离事件，因为这两个物种在系统发育树上并不构成姐妹群。在波索湖内，C. possoensis表现出异常高的遗传多样性（24种单倍型；h = 0.876；π = 0.016），并呈现出明显的微地理结构，可划分为三个系统地理分区（北部：Tentena和Siuri；东部：Tando Nceppo和Busogo Beach；西南部：Bancea和Pendolo），各分区均以独特的单倍群为特征。值得注意的是，各分区之间的最大分化程度（K2P = 2.33%）接近于C. possoensis与C. linduensis之间的种间遗传距离（K2P = 2.42%），表明湖内线粒体分化已达到接近种间水平。相反，C. linduensis表现出近乎泛混交的状态以及极度贫乏的遗传多样性（3种单倍型；h = 0.246；π = 0.0004），这表明其在受限栖息地内长期处于种群动态停滞状态。 C. possoensis所呈现的深度系统地理分区表明，在保护规划中，其离散种群应被视为独立的管理单元（MUs），以保护局域适应的基因复合体；而C. linduensis严重贫乏的基因库使其对环境干扰和入侵物种具有极高脆弱性，因此亟需开展IUCN红色名录评估。为验证这些线粒体边界并为未来保护策略提供依据，强烈建议开展多标记和全基因组范围的重新评估。
关于淡水蛤属（Corbicula）的全球研究，常常因入侵性雄核生殖谱系发生线粒体DNA捕获以及克隆繁殖而受到干扰。相比之下，苏拉威西古湖中的特有Corbicula 通过有性生殖繁衍，为线粒体群体遗传学提供了一个独特且高度可靠的研究系统。本研究首次利用细胞色素c氧化酶亚基I（COI）标记，为两种特有种——波索湖的Corbicula possoensis 和林杜湖的C. linduensis——建立了群体遗传学框架。我们分析了90条新获得的COI序列，这些序列来自C. possoensis（6个采样点）和C. linduensis（3个采样点），并结合GenBank中的参考序列，以评估遗传多样性、群体结构和系统地理格局。分层AMOVA显示，两湖之间存在深度分化（Φ_CT = 0.607），这与长期独立隔离相一致，而非源于单一共享的地理隔离事件；系统发育分析中，这两个物种并不构成姐妹群。在波索湖内，C. possoensis表现出异常高的遗传多样性（24个单倍型；h = 0.876；π = 0.016），并呈现显著的微地理结构，划分为三个系统地理分区（北部：Tentena和Siuri；东部：Tando Nceppo和Busogo Beach；西南部：Bancea和Pendolo），每个分区均由不同的单倍群所表征。值得注意的是，各分区之间的最大分化程度（K2P = 2.33%）接近于C. possoensis与C. linduensis之间的种间遗传距离（K2P = 2.42%），表明湖内线粒体分化已达到接近种间水平。相反，C. linduensis表现出近似泛混交以及极端的遗传匮乏（3个单倍型；h = 0.246；π = 0.0004），说明其在受限栖息地内长期处于种群统计学上的停滞状态。C. possoensis中深度的系统地理分区表明，在保护规划中，其离散种群应被视为独立的管理单元（MUs），以保护地方适应的基因复合体；而C. linduensis极度贫乏的基因库使其对环境干扰和入侵物种极为脆弱，因此亟需开展IUCN红色名录评估。为验证这些线粒体界限并为未来保护策略提供依据，强烈建议开展基于多标记和全基因组范围的重新评估。
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.02.735996v1?rss=1
🏷️ 系统地理学 线粒体COI 群体遗传结构 遗传多样性 淡水蛤蜊 保护生物学