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人类内源性逆转录病毒(HERV)是来源于远古逆转录病毒感染的可移动遗传序列。尽管它们通常处于沉默状态,但其再激活已被认为与某些神经退行性疾病中的基因失调、衰老以及免疫相关转录致病机制有关。帕金森病(PD)是第二常见的神经退行性疾病,但其病因及HERV再激活机制仍知之甚少。本研究考察了早期PD中位点特异性的HERV表达,包括遗传性和非遗传性病例(全部PD)、无已知遗传病因的特发性PD(iPD)以及由富亮氨酸重复激酶2突变驱动的PD(LRRK2 PD)。我们分析了来自492名个体的全血RNA测序样本(358例全部PD,其中256例为iPD,63例为LRRK2 PD,134例为健康对照(HC))。在全部PD与HC的比较中,我们鉴定出20个显著失调的HERV位点。iPD分析中有5个HERV位点与之共享,LRRK2 PD中有1个HERV位点与之共享。值得注意的是,这些共享位点包括HERV-H和ERVLE元件,提示存在独立于疾病亚型的稳健疾病相关逆转录病毒信号。我们发现,这些HERV邻近基因揭示了与PD发病机制相关的通路。免疫细胞去卷积分析显示,与HC相比,各PD队列均表现出中性粒细胞丰度增加以及静息CD4+记忆T细胞比例降低,这与既往外周免疫研究中观察到的中性粒细胞—淋巴细胞比值一致。PD人群的全血中存在转录组层面的HERV改变,并与基础细胞通路失调及外周免疫重塑相关。我们的研究结果推动了对位点特异性HERV表达的实验验证,将其作为一种候选的基于血液的分子特征,具有为PD神经炎症和神经退行性过程提供信息的潜力。
帕金森病中的移动DNA活性:内源性逆转录病毒的位点特异性视角 | bioRxiv
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帕金森病中的移动DNA活性:内源性逆转录病毒的位点特异性视角
Elizabeth T. Banda-Arnold
Charles S. Venuto
Keith A. Crandall
doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.03.736370
Elizabeth T Banda-Arnold 1 乔治·华盛顿大学米尔肯公共卫生学院,生物统计与生物信息学系,计算生物学研究所,美国华盛顿哥伦比亚特区 20052;
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发布于 2026 年 7 月 3 日。
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帕金森病中的移动DNA活性:内源性逆转录病毒的位点特异性视角
Elizabeth T. Banda-Arnold
Charles S. Venuto
Keith A. Crandall
bioRxiv
2026.07.03.736370; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.03.736370
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帕金森病中的移动DNA活性:内源性逆转录病毒的位点特异性视角
Elizabeth T. Banda-Arnold
Charles S. Venuto
Keith A. Crandall
bioRxiv
2026.07.03.736370; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.03.736370
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.03.736370v1?rss=1
🏷️ 帕金森病 内源性逆转录病毒 RNA测序 转录组失调 外周免疫重塑
来源出处
帕金森病中的移动DNA活性:内源性逆转录病毒的位点特异性视角
https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.03.736370v1?rss=1