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横纹样肿瘤是一类侵袭性极强的罕见儿童癌症,预后较差,主要影响年龄极小的儿童。其特征是SMARCB1或SMARCA4发生双等位基因缺失,且这一事件被怀疑发生于产前。然而,其基因组演化过程尚未得到充分理解。本文构建了迄今为止规模最大的横纹样肿瘤全基因组测序队列,包括来自88名儿童的97例肿瘤。我们发现,在42%的病例中,驱动基因的双等位基因失活是通过拷贝数中性杂合性缺失(copy number neutral-loss of heterozygosity, CN-LOH)发生的。我们利用这些CN-LOH事件以及肿瘤基因组中与年龄相关突变的稳定积累,估算了供体在驱动事件发生时以及克隆扩增出现时的年龄。在所有存在CN-LOH的病例中,驱动基因的缺失均发生于产前发育的极早期。然而,最终导致肿瘤形成的克隆扩增则发生于婴儿期的不同时间点,甚至可晚于始发事件获得后的数年。这些结果表明,除遗传驱动事件之外,可能还需要其他因素来促进横纹样肿瘤的发生。
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横纹样肿瘤是一类极具侵袭性的罕见儿童肿瘤,生存率较低,主要影响年龄非常小的儿童。其特征是 SMARCB1 或 SMARCA4 的双等位基因缺失,这一事件被怀疑发生于产前。然而,人们对其基因组演化的理解仍然有限。在持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。
本文依据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议 提供。
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发布于 2026 年 7 月 3 日。
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创始遗传事件与横纹样肿瘤扩增之间的可变潜伏期
Monica Sanchez-Guixe, Alex Cebria-Xart, Naomi Fabre, Carlos J Rodriguez-Hernandez, Morena Pinheiro-Santin, Cinzia Lavarino, Jarno Drost, Ruben Van Boxtel, Nuria Lopez-Bigas, Alexandra Avgustinova, Abel Gonzalez-Perez
bioRxiv 2026.06.30.735306; doi: https://doi.org/10.64898/2026.06.30.735306
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创始遗传事件与横纹样肿瘤扩增之间的可变潜伏期
Monica Sanchez-Guixe, Alex Cebria-Xart, Naomi Fabre, Carlos J Rodriguez-Hernandez, Morena Pinheiro-Santin, Cinzia Lavarino, Jarno Drost, Ruben Van Boxtel, Nuria Lopez-Bigas, Alexandra Avgustinova, Abel Gonzalez-Perez
bioRxiv 2026.06.30.735306; doi: https://doi.org/10.64898/2026.06.30.735306
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.30.735306v1?rss=1
🏷️ 横纹样肿瘤 SMARCB1/SMARCA4 CN-LOH 全基因组测序 克隆扩增 儿童肿瘤