急性髓系白血病中与疾病分期和风险相关的RNA编辑特征及其在基于外周血评估中的应用

root 提交于 周六, 07/04/2026 - 02:47
RNA编辑是一种广泛存在的转录后调控机制,但其在急性髓系白血病(AML)中的作用仍未得到充分阐明。我们采用严格的发现流程以及考虑过度离散和重复测量的β-二项回归框架,对59例配对的初诊-复发AML样本和8例年龄匹配的健康对照中的RNA编辑进行了分析。共鉴定出166,323个高置信度RNA编辑位点,定位于5,917个基因。于所检验位点中,1.2%–3.6%随疾病阶段或ELN-2022风险分组而发生显著变化。疾病阶段特异性的编辑特征可区分健康对照、初诊和复发样本,其中与复发相关的信号在一个独立的AML队列中得到了验证。ELN-2022风险特异性的编辑特征显示,中危组与高危组之间存在显著重叠。跨队列分析鉴定出4个骨髓(BM)编辑位点,分别位于TMEM165、COQ4、TIMM17A和PLXDC2中,且可重复地与复发相关;同时鉴定出1个外周血(PB)编辑位点,位于ABHD18中,在较高风险的ELN-2022分组中升高。大多数编辑位点在BM和PB之间是共享的;仅有2.1%–2.3%表现出组织特异性差异。较高的全局编辑水平与白血病状态、白细胞计数及部分临床特征相关。这些发现揭示了与AML疾病阶段和风险相关的、可重复的RNA编辑特征,并支持将RNA编辑生物标志物用于PB中的疾病评估。

RNA编辑是一种广泛存在的转录后调控机制,但其在急性髓系白血病(AML)中的作用仍未得到充分阐明。我们采用严格的发现流程以及考虑过度离散性和重复测量的β-二项回归框架,对59对诊断—复发AML样本和8名年龄匹配的健康对照进行了RNA编辑分析。共鉴定出166,323个高置信度RNA编辑位点,这些位点定位于5,917个基因。于所检测位点中,1.2%–3.6%因疾病阶段或ELN-2022风险分组而呈现显著变化。疾病阶段特异性的编辑特征能够区分健康对照、诊断期样本和复发期样本,其中与复发相关的信号在一个独立的AML队列中得到了验证。ELN-2022风险特异性的编辑特征显示,中危组与高危组之间存在大量重叠。跨队列分析鉴定出4个骨髓(BM)编辑位点,分别位于TMEM165、COQ4、TIMM17A和PLXDC2中,这些位点与复发呈可重复关联;同时还鉴定出1个外周血(PB)编辑位点,位于ABHD18中,并在较高风险的ELN-2022分组中呈升高。大多数编辑位点在BM和PB之间是共享的;仅有2.1%–2.3%表现出组织特异性差异。较高的全局编辑水平与白血病状态、白细胞计数及部分临床特征相关。这些发现鉴定出与AML疾病阶段和风险相关、具有可重复性的RNA编辑特征,并支持将RNA编辑生物标志物用于PB疾病评估。


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.29.735403v1?rss=1

🏷️ 急性髓系白血病 RNA编辑 疾病分期 复发风险 外周血生物标志物