迈向外生菌根真菌的遗传指标：有效种群大小的估算

外生菌根（EM）真菌对森林生态系统至关重要，能够支持树木的生长与存活。然而，它们在保护政策与保护行动中的纳入仍然有限，而且人们对其遗传多样性的现状知之甚少，而遗传多样性对于其长期存活与适应至关重要。《全球生物多样性框架》采用了一个基于有效群体大小（Ne）的遗传指标，以监测所有物种的遗传多样性。迄今为止，对于具有复杂生活史特征的物种而言，作为关键参数的Ne如何被可靠评估仍不明确。外生菌根真菌是一个高度多样化的类群，表现出具有部分克隆繁殖的单倍体—二倍体生活史。在此，我们回顾相关文献，以理解这些生活史特征可能如何影响六种EM真菌的Ne及其估算。我们利用选定研究中的8个遗传与基因组数据集，对19个种群的Ne进行了估算。我们采用连锁不平衡（LD）法和同胞频率（SF）法对Ne估算值进行了比较。我们检验了由于部分克隆性和遗传结构梯度所导致的Ne估算变化，并评估了遗传标记数量是否会影响估算精度。结果表明，当存在大型克隆体以及种群界定不正确时，Ne估算会出现系统性偏差。我们发现，这两种方法对这些因素均不稳健，因此在EM真菌的保护评估中并不可靠。本研究为进一步探索生活史特征与外生菌根真菌有效群体大小之间的联系提供了新的视角。

外生菌根（EM）真菌对森林生态系统至关重要，能够支持树木的生长与存活。然而，它们在保护政策与保护行动中的纳入仍然有限，而且关于其遗传多样性状况的认知也十分不足，而遗传多样性对于其长期存续与适应至关重要。《全球生物多样性框架》采用了基于有效群体大小（Ne）的遗传指标，以监测所有物种的遗传多样性。迄今为止，对于具有复杂生活史特征的物种而言，如何可靠地评估这一关键参数Ne仍不明确。外生菌根真菌是一个高度多样化的分类群，表现出单倍—二倍体生活史，并具有部分克隆繁殖特征。在此，我们回顾相关文献，以理解这些生活史特征可能如何影响六种外生菌根真菌的Ne及其估算。我们利用选定研究中的8个遗传与基因组数据集，对19个种群的Ne进行了估算。我们采用连锁不平衡（LD）法和同胞频率（SF）法对Ne估计值进行了比较。我们检验了由于部分克隆性和遗传结构梯度导致Ne估计值如何变化，以及遗传标记数量是否会影响估计的精确性。我们表明，当存在大型克隆体且种群界定不正确时，Ne估算会出现系统性偏差。我们发现，这两种方法对这些因素均缺乏稳健性，因此在外生菌根真菌的保护评估中并不可靠。本研究为进一步探究生活史特征与外生菌根真菌有效群体大小之间的联系提供了新的视角。

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📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.30.735680v1?rss=1

🏷️ 外生菌根真菌 有效种群大小 遗传多样性 部分克隆繁殖 种群遗传学