- 5 次围观
流式细胞术产生高维单细胞蛋白质测量数据，这些数据是免疫分型和临床监测的核心。然而，其分析仍在很大程度上依赖人工门控，这种方法劳动密集、可重复性差，且不适用于大规模标记物面板。现有计算方法通常将分类或发现任务彼此孤立地处理，把细胞类型身份视为事后注释，而不是生成模型本身的一部分。我们提出 MARVIN，这是一种半监督变分自编码器，通过在潜在空间中引入高斯混合先验，编码了细胞组织为离散群体并在群体内存在连续变异的假设。由于每个混合成分代表一个不同的细胞群体，分类、发现和密度估计因而成为同一表征的互补视角。 在公开基准数据上，MARVIN 仅使用低至 10% 的标注细胞即可达到或超过现有方法的性能。仅在健康样本上训练时，它能够通过升高的重构误差识别白血病细胞，从而提供一种无监督异常检测信号。在配对刺激数据上，它在保持稳定群体分配的同时，捕捉到丰度和标记物表达在患者水平分辨率上的条件特异性变化。MARVIN 为开源软件，并设计用于本地部署，能够适应机构特异性的面板和仪器。
2 列日大学，人工智能科学实验室（SAIL），蒙特菲奥里研究所，比利时列日；列日大学，列日大学医院中心，临床血液学，比利时列日； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY 4.0 国际许可协议 公开提供。
返回顶部 上一页 下一页
发布于 2026 年 7 月 3 日。
下载 PDF 数据/代码 电子邮件
感谢您有兴趣传播 bioRxiv 的内容。 您的电子邮件 * 您的姓名 * 发送至 * 请输入多个地址，每行一个，或用逗号分隔。
您将要通过电子邮件发送以下内容 具有结构化潜在群体的生成式细胞表型分析
邮件主题 （您的姓名）从 bioRxiv 转发了一个页面给您
邮件正文 （您的姓名）认为您可能希望查看 bioRxiv 网站上的此页面。
您的个人留言
验证码 此问题用于测试您是否为人工访问者，并防止自动垃圾信息提交。
分享 具有结构化潜在群体的生成式细胞表型分析
Fanny Bodart，Adrien De Voeght，Frederic Baron，Gilles Louppe bioRxiv 2026.06.30.735507； doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.30.735507
分享本文： 复制
引文工具 具有结构化潜在群体的生成式细胞表型分析
Fanny Bodart，Adrien De Voeght，Frederic Baron，Gilles Louppe bioRxiv 2026.06.30.735507； doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.30.735507
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.30.735507v1?rss=1
🏷️ 流式细胞术 单细胞蛋白质组 半监督变分自编码器 高斯混合先验 细胞表型分析 异常检测