黑腹果蝇蛋白质内在无序的位置依赖性

蛋白质结构柔性的功能相关性仍存在争议，但实验和计算证据仍在不断积累。为解决这一问题，许多研究考察了内在无序性；该概念通常指在生理条件下推定缺乏结构，并表现出高柔性/构象异质性的肽段或整个蛋白质序列。这些研究面临诸多挑战，例如计算预测结果相互矛盾，以及内在无序区域的位置与其他蛋白质性质之间关系不明确。我们在黑腹果蝇（Drosophila melanogaster）中，利用多种蛋白质性质的残基水平预测，在全基因组尺度上应对这些挑战。我们采用单一方法和共识方法来量化内在无序性的普遍程度，并通过检验蛋白质序列沿线的差异来尝试推断其功能。内在无序性在蛋白质末端区域中很可能比在内部区域更常见，而不同区域之间的氨基酸频率也可能存在显著差异，这种差异似乎更可能反映内在无序性的功能，而不仅仅是整个蛋白质组范围内的效应。 三级结构可能构成蛋白质序列中内在无序性分布普遍程度的基础；与埋藏于溶剂之外的环境相比，这种普遍程度在推定为溶剂暴露的环境中变化更大。蛋白质结合似乎是内在无序性的主要功能，我们的结果支持这样一种观点：结构柔性促进了结合可塑性，并表明位置和蛋白质长度是这一关系中的影响因素。核酸结合和连接子似乎是不如蛋白质结合常见的无序功能，但核酸结合似乎更多定位于蛋白质末端。残基水平的选择压力估计表明，除N端区域外，无序区域通常在比有序区域更弱的序列约束下进化。无序性预测中的偏倚是许多观察结果中的一个重要因素，但不太可能构成全部解释。这些发现进一步强化了对柔性具有功能相关性的支持，增进了对蛋白质结构架构与功能的理解，并为实验研究提供了推动力。

蛋白质结构柔性在功能中的相关性仍存在争议，但实验和计算证据仍在不断积累。许多针对这一问题的研究聚焦于内在无序性，该术语通常指在生理条件下推定缺乏结构并表现出高柔性/构象异质性的肽段或整个蛋白质序列。这些研究工作面临诸多挑战，例如相互冲突的计算预测，以及内在无序区域位置与其他蛋白质性质之间关系的不明确。我们在全基因组尺度上应对这些挑战于

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.02.732782v1?rss=1

🏷️ 内在无序蛋白 蛋白质结构柔性 位置依赖性 黑腹果蝇 蛋白质结合 全基因组分析