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高内涵成像正被应用于在日益复杂的三维(3D)细胞培养模型(如肿瘤球和类器官)中实现定量荧光读出。与传统的二维(2D)检测相比,3D检测能更好地表征生物学异质性,但其需要更复杂的样品制备、3D成像和3D图像分析,这些因素都可能影响此类检测的准确性和精密度。我们采用由NRAS激活的黑色素瘤细胞系19161形成的肿瘤球作为代表性3D表型检测模型,并对其进行改造使其表达ERK激酶易位报告基因(KTR),该检测在96孔板中进行。肿瘤球经ERK激活剂TPA以及一系列不同浓度的MEK抑制剂Binimetinib处理。采用双视角斜平面显微镜(dOPM)——一种单物镜光片显微镜——进行具有亚细胞空间分辨率的3D活细胞成像,并在4个不同研究机构分别开展该实验。采用完全相同的3D分析流程和参数对结果进行分析。 我们使用线性混合效应模型评估了检测读出的变异。孔水平的随机方差可以忽略不计(SD = 0.0048,相对于参考研究点KTR生物传感器读出范围0.17),表明技术噪声较低。与DMSO对照相比,所有研究点的处理效应均呈剂量依赖性,且具有高度统计学显著性(Dunnett校正后 p利用双视角斜平面显微镜进行三维高内涵分析的多中心可重复性研究 | bioRxiv
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利用双视角斜平面显微镜进行三维高内涵分析的多中心可重复性研究
查看 ORCID 主页 Hugh Sparks, Yuriy Alexandrov, Mar Arias-Garcia, Chris Bakal, Eduard Batlle, Vicky Bousgouni, Neil Carragher, Julien Colombelli, Jayne Culley, Nathan Curry, Lucas Dent, Chris Dunsby, 查看 ORCID 主页 Liuba Dvinskikh, Edwin Garcia, Nikolaos N. Giakoumakis, Nils Gustafsson, Montserrat Llanses, Martin Lee, 查看 ORCID 主页 Kanad N. Mandke, Dan Marks, 查看 ORCID 主页 Iain McNeish, 查看 ORCID 主页 Colin Ratcliffe, 查看 ORCID 主页 Erik Sahai, Theresa Suckert
doi: https://doi.org/10.64898/2026.06.29.735376
Hugh Sparks 1 伦敦帝国学院; 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 该作品依据 CC-BY 4.0 国际许可协议 公开提供。
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发布于 2026 年 7 月 3 日。 下载 PDF 电子邮件
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Hugh Sparks, Yuriy Alexandrov, Mar Arias-Garcia, Chris Bakal, Eduard Batlle, Vicky Bousgouni, Neil Carragher, Julien Colombelli, Jayne Culley, Nathan Curry, Lucas Dent, Chris Dunsby, Liuba Dvinskikh, Edwin Garcia, Nikolaos N. Giakoumakis, Nils Gustafsson, Montserrat Llanses, Martin Lee, Kanad N. Mandke, Dan Marks, Iain McNeish, Colin Ratcliffe, Erik Sahai, Theresa Suckert
bioRxiv 2026.06.29.735376; doi: https://doi.org/10.64898/2026.06.29.735376
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利用双视角斜平面显微镜进行三维高内涵分析的多中心可重复性研究
Hugh Sparks, Yuriy Alexandrov, Mar Arias-Garcia, Chris Bakal, Eduard Batlle, Vicky Bousgouni, Neil Carragher, Julien Colombelli, Jayne Culley, Nathan Curry, Lucas Dent, Chris Dunsby, Liuba Dvinskikh, Edwin Garcia, Nikolaos N. Giakoumakis, Nils Gustafsson, Montserrat Llanses, Martin Lee, Kanad N. Mandke, Dan Marks, Iain McNeish, Colin Ratcliffe, Erik Sahai, Theresa Suckert
bioRxiv 2026.06.29.735376; doi: https://doi.org/10.64898/2026.06.29.735376
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.29.735376v1?rss=1
🏷️ 三维高内涵成像 双视角斜平面显微镜 肿瘤球模型 ERK-KTR生物传感器 多中心可重复性 活细胞成像