第二次鼠疫大流行对三个人人群的基因组影响|||北京沫之东生物技术有限公司

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第二次鼠疫大流行（14世纪初至19世纪初）由鼠疫耶尔森菌引起，对欧亚大陆和北非的人口、社会经济及文化产生了深远影响。据估计，欧洲和中东的许多地区损失了40%至60%的人口，部分地区的死亡率甚至更高。尽管近年来已有若干基于古DNA的研究，但鼠疫耶尔森菌暴露是否在人类基因组中的保护性遗传变异上驱动了强烈的正向选择，以及它如何塑造了迁徙模式，仍存在争议。在本文中，我们分析了一个显著更大、覆盖度更高且具有地理多样性的数据集。该数据集基于对529名古代个体基因组的鸟枪法测序，平均测序深度为8.8倍，这些个体分别生活于疫情传入北欧三个地点——特隆赫姆（挪威）、隆德（瑞典）和维尔纽斯（立陶宛）——之前或之后。针对选择信号的全基因组扫描未提供证据表明，由鼠疫耶尔森菌暴露驱动的强烈正向选择作用于特定遗传变异：我们既未重复此前研究报道的选择信号，也未发现新的达到全基因组显著性的候选位点。然而，在这三个地点中，我们均观察到远距离移民减少的证据，这表现为在鼠疫耶尔森菌传入后祖源多样性的下降，并且这一变化大体上与维京时代的结束、基督教化以及小冰期的开始相吻合。我们的结果为中世纪晚期斯堪的纳维亚和波罗的海地区重大社会历史变迁所造成的人口学影响提供了重要见解，并将基督教化与疫情发生前祖源多样性的增加联系起来。

6 文化遗产系，考古学博物馆，斯塔万格大学，Peder Klows Gate 31A，4036 Stavanger，挪威；在 Google Scholar 上查找该作者在 PubMed 上查找该作者在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。本文依据 CC-BY 4.0 国际许可协议公开提供。

发布于 2026 年 7 月 2 日。

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Xiaodong Liu， Kristjan Moore， S. Sunna Ebenesersdottir， Caroline Arcini， Gordon-Turner Walker， Sean Dexter Denham， Philip Slavin， Maja Birk Sotofte， Sascha Dreyer Nielsen， Martin R. Ellegaard， Ashild J. Vagene， Ashot Margaryan， Miren Iraeta-Orbegozo， Dorothea Mylopotamitaki， Jason Laffoon， Bente Philippsen， Maria Cinthio Rydahl， Rimantas Jankauskas， Justina Kozakaite， Lars Alfredsson， Gianpiero L. Cavalleri， Hao Shan Chen， Olivia Cheronet， Lea Demetz， Doris Nguemo Emeruem， Daniel Fernandes， Pere Gelabert， Edmund Gilbert， Thomas Folkmann Hansen， Eivind Hovig， Ingrid Kockum， Alejandro Llanos-Lizcano， Victoria Oberreiter， Tomas Olsson， Ron Pinhasi， Elisa Praxmarer， Birgitte Skar， Thomas Werge， Hans K. Stenoien， Hannes Schroeder， Michael D Martin， Axel Christophersen， Kari Stefansson， M Thomas P Gilbert， Shyam Gopalakrishnan， Agnar Helgason， Ida Moltke

bioRxiv 2026.06.29.730585； doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.29.730585