起始密码子上下文决定人类寄生虫利什曼原虫中翻译偶联的mRNA降解及协调表达

root 提交于 周五, 07/03/2026 - 18:47
在缺乏经典的、基于启动子的转录调控机制的情况下,利什曼原虫已进化出替代性的适应性基因表达调控机制,其中包括通过mRNA差异性周转实现的转录后调控。尽管这一机制被认为对利什曼原虫至关重要,但这些寄生虫中转录本稳定性的一些基本方面仍有待阐明,例如由翻译起始介导的mRNA降解所发挥的作用。我们通过研究L. donovani中起始密码子背景序列(Kozak序列)在基因表达中的作用,弥补了这一重要空白。对锥虫科生物基因组中的Kozak序列进行绘制显示,在属和亚属层面上核苷酸偏好存在重要差异,提示其具有重要的顺式调控功能。在单一物种内,所有可能的Kozak序列中仅有一个小子集与多个起始密码子相关联,这进一步支持了其在表达调控中的作用。表达受不同Kozak变体控制的EGFP的转基因L. donovani株系确实表明,起始密码子的核苷酸背景可直接调节蛋白表达和mRNA稳定性,并且这与mRNA向重多核糖体的募集增加相关。将寄生虫暴露于翻译抑制剂环己酰亚胺后,由弱Kozak序列驱动的EGFP表达得到恢复,揭示了mRNA稳定性与Kozak介导的可翻译性之间的直接联系。对转录或翻译延长被阻断的寄生虫进行RNA-seq分析表明,富集于RNA修饰和假尿苷合成GO术语的转录本是翻译依赖性mRNA周转的关键靶标。这些转录本按具有不同Kozak特征的功能簇发生分离,进一步提示Kozak序列组成界定了利什曼原虫中受Kozak支配的调控子。在这一调控框架内,-3位核苷酸被确定为驱动转录本丰度差异的关键位置决定因素。我们的研究揭示了翻译起始偶联的mRNA降解在利什曼原虫基因表达调控中的关键作用,为寄生虫适应性中的转录后调控增添了此前未受到充分重视的一层机制。

起始密码子环境决定人类寄生虫利什曼原虫中翻译偶联的 mRNA 降解与协同表达 | bioRxiv

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起始密码子环境决定人类寄生虫中的翻译偶联 mRNA 降解与协同表达 利什曼原虫

查看 ORCID 主页 Ana Maria MURTA SANTI, 查看 ORCID 主页 Thomas COKELAER, 查看 ORCID 主页 Juliana PIPOLI DA FONSECA, 查看 ORCID 主页 Paul JENKINS, Elena TIKHONOVA, Cristian RODRIGUEZ-ALMONACID, Andrey KARAMYSHEV, Zemfira KARAMYSHEVA, 查看 ORCID 主页 Gerald SPÄTH

doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.01.735800

Ana Maria MURTA SANTI 1 巴斯德研究所,巴黎西岱大学,INSERM U1347,分子寄生虫学与信号传导研究单元,25 Rue du Dr Roux,75015 Paris,France;巴西库里提巴,Fiocruz Paraná,Carlos Chagas 研究所;;

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发布于 2026 年 7 月 2 日。

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bioRxiv 2026.07.01.735800; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.01.735800

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bioRxiv 2026.07.01.735800; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.01.735800


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.01.735800v1?rss=1

🏷️ 利什曼原虫 Kozak序列 翻译起始 mRNA降解 转录后调控 RNA-seq