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我们报告了一只雌性大灰林鸮(Strix nebulosa lapponica)的染色体水平基因组组装。该组装包含两个伪单倍型,大小分别为1554 Mb和1242 Mb,其中83.2%和91.4%的序列分别被锚定到40条常染色体上,此外W和Z性染色体也均被定位于hap1中。该组装完整性较高(BUSCO分别为99.2%和94.8%),hap1和hap2分别注释到18,493个和17,279个蛋白质编码基因。该基因组为研究大灰林鸮的遗传变异和染色体演化建立了参考。与先前的S. nebulosa组装相比,该组装包含了两条性染色体,分离了此前被折叠的区域,并总计解析出82条染色体。尽管较大的染色体在不同鸮类组装之间总体上表现出保守的共线性,但额外恢复出的与微染色体相关的保守基因表明,相较于基于HiFi的组装,ONT测序读段提高了对最小染色体的解析能力。
欧亚大灰猫头鹰(Strix nebulosa lapponica)(Thunberg,1798)的染色体水平基因组组装 | bioRxiv
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欧亚大灰猫头鹰 Strix nebulosa lapponica (Thunberg,1798)的染色体水平基因组组装
Marius A. Strand, Inga A. Froland Steindal, Erlend Ragnhildstveit, Roar Solheim, Ole K. Torresen, Morten Skage, Giada Ferrari, Ave Tooming-Klunderud, Kjetill S. Jakobsen
doi: https://doi.org/10.64898/2026.06.29.735218
Marius A. Strand 1 奥斯陆大学生物科学系,生态与进化综合研究中心(CEES),挪威奥斯陆; 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY 4.0 International 许可协议公开提供。
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发布于 2026 年 7 月 2 日。 下载 PDF 补充材料 数据/代码 电子邮件
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欧亚大灰猫头鹰 Strix nebulosa lapponica (Thunberg,1798)的染色体水平基因组组装
Marius A. Strand, Inga A. Froland Steindal, Erlend Ragnhildstveit, Roar Solheim, Ole K. Torresen, Morten Skage, Giada Ferrari, Ave Tooming-Klunderud, Kjetill S. Jakobsen
bioRxiv 2026.06.29.735218; doi: https://doi.org/10.64898/2026.06.29.735218
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欧亚大灰猫头鹰 Strix nebulosa lapponica (Thunberg,1798)的染色体水平基因组组装
Marius A. Strand, Inga A. Froland Steindal, Erlend Ragnhildstveit, Roar Solheim, Ole K. Torresen, Morten Skage, Giada Ferrari, Ave Tooming-Klunderud, Kjetill S. Jakobsen
bioRxiv 2026.06.29.735218; doi: https://doi.org/10.64898/2026.06.29.735218
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.29.735218v1?rss=1
🏷️ 染色体水平基因组 鸟类基因组组装 性染色体 染色体演化 微染色体解析