- 7 次围观
高参数细胞术对于临床诊断至关重要，它能够实现精确的免疫细胞谱系分析、改善患者分层与监测，同时加深对疾病和治疗背景下细胞反应的理解。细胞术数据的数量正在快速增长，随之而来的是对不同数据集进行合并以开展统一分析的需求。 在此，我们提出了 CyStainer，这是一种基于 Transformer 的变分自编码器，在若干与标志物预测相关的关键任务上表现出与现有方法相当或更优的性能。作为一项关键创新，我们证明了 CyStainer 即使在没有一组共享骨干标志物的情况下，也能够进行标志物插补。我们使用真实世界的 FACS、CyTOF、InfinityFlow 和 CITE-seq 数据集开展了多项基准测试，结果表明 CyStainer 是一种稳健且灵活的工具，可用于面板合并、标志物插补、数据集整合以及对未见样本进行虚拟染色。
CyStainer：一种基于 Transformer 的变分自编码器，用于高参数细胞术中稳健的标记物插补 | bioRxiv
跳转至主要内容
首页 关于 投稿 提醒 / RSS 搜索此关键词 高级搜索 最新结果
CyStainer：一种基于 Transformer 的变分自编码器，用于高参数细胞术中稳健的标记物插补
查看 ORCID 个人主页 Konstantin Ivanov， Mouhamad Al Moussawy， 查看 ORCID 个人主页 Frederik Kirk， 查看 ORCID 个人主页 Rounioja Samuli， 查看 ORCID 个人主页 Olli Lohi， 查看 ORCID 个人主页 Lars Olsen， 查看 ORCID 个人主页 Signe Modvig， 查看 ORCID 个人主页 Ville Hautamäki， 查看 ORCID 个人主页 Merja Heinäniemi
doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.30.735235
Konstantin Ivanov 1 芬兰东芬兰大学医学院，库奥皮奥，芬兰； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY 4.0 国际许可协议 公开提供。
返回顶部
上一项 下一项
发表于 2026 年 6 月 30 日。
下载 PDF 补充材料 数据/代码 电子邮件
感谢您有兴趣传播 bioRxiv 的内容。
您的电子邮件 *
您的姓名 *
发送至 *
请输入多个地址，每行一个，或以逗号分隔。
您将要通过电子邮件发送以下内容
CyStainer：一种基于 Transformer 的变分自编码器，用于高参数细胞术中稳健的标记物插补
邮件主题
（您的姓名）从 bioRxiv 转发了一个页面给您
邮件正文
（您的姓名）认为您可能希望查看 bioRxiv 网站上的这个页面。
您的个人留言
验证码
此问题用于测试您是否为人类访客，并防止自动化垃圾信息提交。
分享
CyStainer：一种基于 Transformer 的变分自编码器，用于高参数细胞术中稳健的标记物插补
Konstantin Ivanov， Mouhamad Al Moussawy， Frederik Kirk， Rounioja Samuli， Olli Lohi， Lars Olsen， Signe Modvig， Ville Hautamäki， Merja Heinäniemi
bioRxiv 2026.06.30.735235； doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.30.735235
分享本文： 复制
引用工具
CyStainer：一种基于 Transformer 的变分自编码器，用于高参数细胞术中稳健的标记物插补
Konstantin Ivanov， Mouhamad Al Moussawy， Frederik Kirk， Rounioja Samuli， Olli Lohi， Lars Olsen， Signe Modvig， Ville Hautamäki， Merja Heinäniemi
bioRxiv 2026.06.30.735235； doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.30.735235
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.30.735235v1?rss=1
🏷️ 流式细胞术 标记物插补 Transformer 变分自编码器 数据集整合