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光学荧光显微技术能够实现对生物结构和动态过程的可视化。然而,其固有的衍射极限,尤其是在轴向方向上的衍射限制,以及与成像深度相关的散射噪声,都会损害图像分辨率和保真度。计算型三维反卷积是缓解这些问题的一种有前景的方法,但其实施受到三维点扩散函数(PSF)不准确且繁琐的理论建模或实验测量,以及低效的三维噪声正则化的制约。此外,在三维超分辨率领域,仍然缺乏用于评估三维超分辨率保真度的标准化工具。本文提出三维自适应反卷积与评估(3D-ADE)工具包,其中包括具有面向物理的自动三维 PSF 标定的 3D-Ada 反卷积,以及用于三维超分辨率质量评估的 3D-SQUIRREL。该工具包有效解决了噪声不稳定性问题,消除了对三维 PSF 标定的需求,并能够可靠评估通过反卷积、物理方法以及深度学习方法实现的三维分辨率扩展的保真度。3D-ADE 可通过多个软件平台访问,增强了三维反卷积的通用性,并填补了三维超分辨率评估工具的空白,从而推动了体积荧光成像应用的发展。
光学荧光显微镜能够可视化生物结构及其动态过程。然而,固有的衍射极限,尤其是在轴向上的限制,以及与成像深度相关的散射噪声,都会降低图像分辨率和保真度。计算三维去卷积是一种有前景的缓解策略,但其实施受限于三维点扩散函数(PSF)理论建模或实验测量的不准确与繁琐,以及无效的三维噪声正则化。此外,在三维超分辨率领域,仍然缺乏用于评估三维超分辨率保真度的标准化工具。在此,我们提出三维自适应去卷积与评估(3D-ADE)工具包,其中包括带有物理导向自动三维PSF校准的3D-Ada去卷积,以及用于三维超分辨率质量评估的3D-SQUIRREL。该工具包能够有效解决噪声不稳定性问题,消除对三维PSF校准的需求,并可靠评估通过去卷积、物理方法以及深度学习方法实现的三维分辨率扩展的保真度。3D-ADE可通过多种软件平台获取,增强了三维去卷积的适用性,并填补了三维超分辨率评估工具的空白,从而推动体积荧光成像应用的发展。
作者声明不存在竞争性利益。
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📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.29.735443v1?rss=1
🏷️ 三维反卷积 体积荧光显微镜 点扩散函数 超分辨率评估 图像复原
来源出处
数据自适应三维反卷积及其在体积荧光显微镜中的评估
https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.29.735443v1?rss=1