对CHIKV感染免疫反应的单细胞转录组分析

root 提交于 周三, 07/01/2026 - 10:47
摘要 背景:基孔肯雅病毒(Chikungunya virus,CHIKV)是一种再度流行的蚊媒甲病毒,可导致急性发热性疾病和严重多关节痛。尽管先天性免疫和适应性免疫反应均会影响疾病结局,但CHIKV在外周血中的细胞免疫发病机制细节尚未得到充分阐明。方法:我们对急性CHIKV感染患者及健康对照受试者的外周血单个核细胞(PBMC)进行了单细胞RNA测序(scRNA-seq)。推断了细胞间相互作用,并通过定量实时PCR(qPCR)和酶联免疫吸附试验(ELISA)对转录组结果进行了正交验证,以评估全身性干扰素刺激反应。此外,利用公开可获得的登革病毒(Dengue virus,DENV)感染单细胞数据进行了比较分析。结果:CHIKV感染显著改变了免疫系统,表现为单核细胞和树突状细胞增多,而T淋巴细胞和B淋巴细胞减少。单核细胞和NK细胞显示出干扰素刺激基因(ISGs)的强烈激活。单核细胞被确定为驱动炎症和免疫反应的关键细胞。在适应性免疫方面,CHIKV促使B细胞分化为具有抗病毒免疫球蛋白的浆母细胞,并导致T细胞和NK样T细胞表现出细胞毒性和衰竭迹象。验证结果显示,IFN-γ、IFN-β1、MX1和ISG15水平均升高。与DENV相比,CHIKV触发了更强烈的、由单核细胞驱动的干扰素反应。结论:急性CHIKV感染可诱导以单核细胞为核心的全身性干扰素反应,并伴随适应性免疫的显著改变。循环中的ISG产物,包括MX1和ISG15,能够反映转录组激活状态,并可能作为评估早期先天性抗病毒反应强度的潜在生物标志物。

摘要 背景:基孔肯雅病毒(Chikungunya virus,CHIKV)是一种再度流行的蚊媒甲病毒,可引起急性发热性疾病和严重的多关节痛。尽管先天性免疫和适应性免疫反应均会影响疾病结局,但CHIKV在外周血中的详细细胞免疫发病机制尚未得到充分阐明。

方法:我们对急性CHIKV感染患者及健康对照受试者的外周血单个核细胞(PBMCs)进行了单细胞RNA测序(scRNA-seq)。推断了细胞间相互作用,并通过定量实时PCR(qPCR)和酶联免疫吸附测定(ELISA)对转录组结果进行了正交验证,以评估全身性干扰素刺激反应。此外,利用公开可获得的登革病毒(DENV)感染单细胞数据进行了比较分析。

结果:CHIKV感染显著改变了免疫系统,表现为单核细胞和树突状细胞增加,而T淋巴细胞和B淋巴细胞减少。单核细胞和NK细胞显示出干扰素刺激基因(ISGs)的强烈激活。单核细胞被确定为驱动炎症和免疫反应的关键细胞。在适应性免疫方面,CHIKV促使B细胞分化为携带抗病毒免疫球蛋白的浆母细胞,并使T细胞和NK样T细胞表现出细胞毒性和耗竭迹象。验证结果显示,IFN-γ、IFN-β1、MX1和ISG15水平均升高。与DENV相比,CHIKV触发了更强烈的、由单核细胞驱动的干扰素反应。

结论:急性CHIKV感染诱导以单核细胞为中心的全身性干扰素反应,并伴随适应性免疫的显著改变。循环中的ISG产物,包括MX1和ISG15,能够反映转录组激活状态,并可作为评估早期先天性抗病毒反应强度的潜在生物标志物。


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.24.734421v1?rss=1

🏷️ 单细胞转录组 CHIKV感染 免疫反应 单核细胞 干扰素刺激基因 外周血单个核细胞