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肠道是产超广谱β-内酰胺酶（ESBL）大肠杆菌的储存库。这些条件致病共生菌对肠道的无症状定植，是肠外感染的重要风险因素。尽管具有临床相关性，ESBL大肠杆菌肠道定植的遗传基础仍然知之甚少。在本研究中，我们阐明了微生物群如何塑造多种ESBL大肠杆菌菌株的适应度图谱，并界定了肠道定植的功能需求。 在微生物群被耗竭的宿主中，定植主要依赖代谢功能。相比之下，在携带微生物群的小鼠中，与黏附和生物被膜形成相关的病原适应性功能，连同附属毒力功能，共同构成决定大肠杆菌适应度的主导因素。与这些观察结果一致，小鼠中的实验进化表明，ESBL大肠杆菌通过增强黏附性而趋同适应复杂微生物群的存在。 这些发现确立了微生物群作为抗生素耐药性条件致病共生菌发生病原适应的主要生态驱动因素。
肠道微生物群竞争选择 ESBL 大肠杆菌中的致病适应性特征 | bioRxiv
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肠道微生物群竞争选择 ESBL 大肠杆菌中的致病适应性特征
Pramod K Jangir，Leonardo F. Lemos Rocha，Marco Molari，Nicolas Wenner，Cecilia Fruet，Pablo Manfredi，Carlos Flores，Anna Sintsova，Roxanne Mouchet，Lisa Diner，Anouk Bertola，Svenja Forster，Elisa Lee，MiCayla Johnson，Malenka Kunz，Andrea Rocker，Adrian Egli，Urs Jenal，Christoph Dehio，Anne-Florence Bitbol，Mederic Diard
doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.25.730905
Pramod K Jangir 1 瑞士巴塞尔大学 Biozentrum，巴塞尔，瑞士；
Leonardo F. Lemos Rocha 1 瑞士巴塞尔大学 Biozentrum，巴塞尔，瑞士；
Marco Molari 1 瑞士巴塞尔大学 Biozentrum，巴塞尔，瑞士；
Nicolas Wenner 1 瑞士巴塞尔大学 Biozentrum，巴塞尔，瑞士；
Cecilia Fruet 2 瑞士洛桑联邦理工学院（EPFL）生命科学学院生物工程研究所，洛桑，瑞士；
Pablo Manfredi 1 瑞士巴塞尔大学 Biozentrum，巴塞尔，瑞士；
Carlos Flores 1 瑞士巴塞尔大学 Biozentrum，巴塞尔，瑞士；
Anna Sintsova 3 瑞士苏黎世联邦理工学院（ETH Zurich）生物系微生物学研究所，苏黎世，瑞士；
Roxanne Mouchet 1 瑞士巴塞尔大学 Biozentrum，巴塞尔，瑞士；
Lisa Diner 1 瑞士巴塞尔大学 Biozentrum，巴塞尔，瑞士；
Anouk Bertola 1 瑞士巴塞尔大学 Biozentrum，巴塞尔，瑞士；
Svenja Forster 1 瑞士巴塞尔大学 Biozentrum，巴塞尔，瑞士；
Elisa Lee 1 瑞士巴塞尔大学 Biozentrum，巴塞尔，瑞士；
MiCayla Johnson 1 瑞士巴塞尔大学 Biozentrum，巴塞尔，瑞士；
Malenka Kunz 1 瑞士巴塞尔大学 Biozentrum，巴塞尔，瑞士；
Andrea Rocker 1 瑞士巴塞尔大学 Biozentrum，巴塞尔，瑞士；
Adrian Egli 4 瑞士苏黎世大学医学微生物学研究所，苏黎世，瑞士
Urs Jenal 1 瑞士巴塞尔大学 Biozentrum，巴塞尔，瑞士；
Christoph Dehio 1 瑞士巴塞尔大学 Biozentrum，巴塞尔，瑞士；
Anne-Florence Bitbol 2 瑞士洛桑联邦理工学院（EPFL）生命科学学院生物工程研究所，洛桑，瑞士；
Mederic Diard 1 瑞士巴塞尔大学 Biozentrum，巴塞尔，瑞士；
通讯作者： mederic.diard{at}unibas.ch
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摘要
肠道是产生超广谱β-内酰胺酶（ESBL）的大肠杆菌的储存库。这些条件致病共生菌在肠道中的无症状定植，是导致肠外感染的一个主要风险因素。尽管具有临床相关性，ESBL 大肠杆菌肠道定植的遗传基础仍然知之甚少。在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议发布。
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发表于 2026 年 6 月 29 日。
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Pramod K Jangir，Leonardo F. Lemos Rocha，Marco Molari，Nicolas Wenner，Cecilia Fruet，Pablo Manfredi，Carlos Flores，Anna Sintsova，Roxanne Mouchet，Lisa Diner，Anouk Bertola，Svenja Forster，Elisa Lee，MiCayla Johnson，Malenka Kunz，Andrea Rocker，Adrian Egli，Urs Jenal，Christoph Dehio，Anne-Florence Bitbol，Mederic Diard
bioRxiv 2026.06.25.730905； doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.25.730905
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肠道微生物群竞争选择 ESBL 大肠杆菌中的致病适应性特征
Pramod K Jangir，Leonardo F. Lemos Rocha，Marco Molari，Nicolas Wenner，Cecilia Fruet，Pablo Manfredi，Carlos Flores，Anna Sintsova，Roxanne Mouchet，Lisa Diner，Anouk Bertola，Svenja Forster，Elisa Lee，MiCayla Johnson，Malenka Kunz，Andrea Rocker，Adrian Egli，Urs Jenal，Christoph Dehio，Anne-Florence Bitbol，Mederic Diard
bioRxiv 2026.06.25.730905； doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.25.730905
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.25.730905v1?rss=1
🏷️ 肠道微生物群 ESBL大肠杆菌 肠道定植 致病适应 生物被膜 实验进化