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颜色多态性可以促进局部适应、维持种内多样性，或反映物种形成的早期阶段。小丑鱼（Amphiprion spp.）通常表现出简单的黑、橙、白色斑纹，但鞍背小丑鱼（Amphiprion polymnus）在黑化程度和垂直条纹数量上表现出显著变异，而这些特征被认为在物种识别中发挥作用。2024年，iNaturalist上的一次分类修订仅依据色彩图案和地理分布，将A. polymnus拆分为多个物种。这引发了一个问题：这些形态型究竟代表真正的物种，还是种内多态性？我们利用基因组数据和基于图像的数据对这一问题进行了检验。我们从该物种分布范围内的七个种群中采集了97个个体，并基于标准化照片量化了其色彩图案。表型和基因组分析揭示出复杂的分化格局。图像分析识别出三个不同的表型簇，其中A. polymnus、A. annamensis和A. laticlavius在鞍状斑形态和垂直条纹延展程度上均表现出一致差异。ADMIXTURE分析解析出三个与这些形态型相对应的独立遗传类群。成对FST（0.54–0.71）和dxy表明，A. polymnus与A. annamensis之间存在极高程度的分化，这与物种水平的分化相一致；而A. laticlavius与A. polymnus之间的分化明显较低（FST 0.09–0.18），与A. annamensis之间的分化则更高（FST 0.64–0.66）。总体而言，表型和基因组数据均显示出结构化变异，但A. laticlavius的分类地位仍然模糊。我们的研究揭示了在整个分布范围内清晰且具有结构性的分化，然而，对这种变异的分类学解释本质上仍然充满挑战。核心问题仍然是：这些模式究竟反映的是一个单一的多态性物种，还是一个由多个近缘物种组成的复合体？
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体色多态性可以促进局部适应、维持种内多样性，或反映物种形成的早期阶段。小丑鱼（Amphiprion 属）通常呈现简单的黑、橙、白色斑纹，但鞍背小丑鱼（Amphiprion polymnus）在黑化程度和垂直条纹数量上表现出显著变异，而这些特征被认为在物种识别中发挥作用。2024 年，iNaturalist 上的一项分类修订仅依据体色斑纹和地理分布，将 A. polymnus 拆分为多个物种。这引出了一个问题：这些形态型究竟代表真实的物种，还是种内多态性？我们利用基因组数据和基于图像的数据对此进行了检验。我们在该物种分布范围内的 7 个种群中采集了 97 个个体，并从标准化照片中量化其体色斑纹。表型和基因组分析揭示出复杂的分化格局。图像分析识别出三个不同的表型簇，其中 A. polymnus、A. annamensis 和 A. laticlavius 各自均表现出稳定的鞍状斑形态和垂直条纹范围差异。ADMIXTURE 分析解析出与这些形态型相对应的三个不同遗传群体。成对 FST（0.54–0.71）和 dxy 表明，A. polymnus 与 A. annamensis 之间存在极高程度的分化，这与物种水平的分化一致；而 A. laticlavius 与 A. polymnus 之间的分化则低得多（FST 0.09–0.18），并且其与 A. annamensis 之间的分化更高（FST 0.64–0.66）。总体而言，表型和基因组数据均显示出结构化变异，但 A. laticlavius 的地位仍不明确。我们的研究揭示了在整个分布范围内清晰且具有结构性的分化，然而对此类变异的分类学解释仍然持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY 4.0 国际许可协议 提供。
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发布于 2026 年 6 月 29 日。
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鞍背小丑鱼 Amphiprion polymnus 的体色多态性：物种还是复合群？
Lucy M. Fitzgerald， Floriane Coulmance， Anna Marcionetti， Theo Gaboriau， Alberto Garcia Jimenez， Prince T. Apag， Melissa Versteeg， Fletcher J. Noble， Kirstin Gaffney， Manon Mercader， Annie G. Diola， Paul John Geraldino， Theresa Rueger， Vincent Laudet， Nicolas Salamin
bioRxiv 2026.06.28.735040； doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.28.735040
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鞍背小丑鱼 Amphiprion polymnus 的体色多态性：物种还是复合群？
Lucy M. Fitzgerald， Floriane Coulmance， Anna Marcionetti， Theo Gaboriau， Alberto Garcia Jimenez， Prince T. Apag， Melissa Versteeg， Fletcher J. Noble， Kirstin Gaffney， Manon Mercader， Annie G. Diola， Paul John Geraldino， Theresa Rueger， Vincent Laudet， Nicolas Salamin
bioRxiv 2026.06.28.735040； doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.28.735040
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.28.735040v1?rss=1
🏷️ 颜色多态性 物种界定 群体基因组学 表型聚类 小丑鱼 分类修订