单细胞转录组学揭示骨关节炎膝关节软骨中软骨细胞状态转变及细胞外基质重塑

骨关节炎软骨具有异质性的软骨细胞状态，然而基于公开单细胞数据，这些状态之间的转变关系仍未得到解析。我们对公开的膝关节软骨单细胞RNA测序数据集GSE255460进行了回顾性重分析，该数据集包含来自8名骨关节炎供体和3名非骨关节炎供体的共19个样本。经过按样本进行的质量控制和双细胞去除后，我们实施了批次校正聚类、基于标志物注释的软骨细胞亚群聚类，以及利用Slingshot进行轨迹推断。针对调节性软骨细胞，我们检测了骨关节炎与对照之间的差异表达，随后进行了基因本体论和KEGG富集分析，并采用Benjamini-Hochberg假发现率

骨关节炎软骨具有异质性的软骨细胞状态，然而基于公开单细胞数据，这些状态之间的转换关系仍未得到解析。我们对公开的膝关节软骨单细胞RNA测序数据集GSE255460进行了回顾性重分析，该数据集包含8例骨关节炎供体和3例非骨关节炎供体，共计19个样本。经按样本进行质量控制和双细胞去除后，我们开展了批次校正聚类、基于标志基因注释的软骨细胞亚群聚类，以及使用Slingshot进行轨迹推断。对调节性软骨细胞进行了骨关节炎组与对照组的差异表达分析，随后采用Benjamini-Hochberg假发现率

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📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.24.734199v1?rss=1

🏷️ 单细胞转录组 骨关节炎 软骨细胞状态转变 细胞外基质重塑 轨迹推断 TGFβ信号通路