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工业化已经重塑了人类肠道微生物组，但其对其他与人类相关的哺乳动物的影响仍知之甚少。家犬提供了一个具有启发性的比较系统，因为它们与人类共享环境和食物系统已达数千年之久，同时仍保留着独特的宿主生物学特征。然而，大多数犬类微生物组研究聚焦于工业化社会中的伴侣动物，这限制了我们对家犬肠道微生物组生态范围的理解。我们分析了来自尼泊尔、泰国、阿拉伯联合酋长国和美国的261只犬的粪便16S rRNA基因谱，这些样本涵盖了采食狩猎型、农耕型、牧业型、城市型和工业化生活方式；在排除近期暴露于抗生素的个体后，最终保留了257只犬。生活方式是与犬肠道微生物组组成相关性最强的测量因素，而且在对来自温带气候地区的成熟、非收容所犬进行限制性分析时，这一结构仍然存在。工业化犬与非工业化犬之间的差异表现为属水平上具有方向性的更替、VANISH样和BloSSUM样微生物类群的重组，以及预测功能潜力的变化。非工业化犬在微生物学上并非一致同质：牧业型犬携带非工业化微生物组特征，但其模式偏离了从采食狩猎型到工业化型的简单连续谱。对按匹配生活方式类别采样的人类进行跨物种比较显示，两种宿主中都存在与生活方式相关的平行重组，但宿主物种仍然是变异的主导轴，而对工业化作出响应的属在很大程度上具有宿主特异性。这些发现扩展了家犬肠道微生物组的生态学基线，并确定工业化是这种长期与人类相关的哺乳动物微生物组重组的一个主要轴线。更广泛地说，这表明共同的生活方式转变能够在不同宿主物种间施加平行的生态压力，同时又不会覆盖宿主特异性的群落组装。
工业化在保留宿主特异性的同时重塑了家犬肠道微生物组 | bioRxiv
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工业化在保留宿主特异性的同时重塑了家犬肠道微生物组
Arya Gautam， Dinesh Bhandari， Kusha Gurung， Aashish Gyawali， Kshitiz Gurung， Pratiksha Yadav， Kyle C.M. Smith， Anique Ahmad， Deena Shrestha， Kimberly Ange-van Heugten， Laura Weyrich， Ajit K Karna， Aashish Jha
doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.29.735155
Arya Gautam 1 Sabitri Sciences；
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发表于 2026年6月29日。
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Arya Gautam， Dinesh Bhandari， Kusha Gurung， Aashish Gyawali， Kshitiz Gurung， Pratiksha Yadav， Kyle C.M. Smith， Anique Ahmad， Deena Shrestha， Kimberly Ange-van Heugten， Laura Weyrich， Ajit K Karna， Aashish Jha
bioRxiv 2026.06.29.735155； doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.29.735155
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工业化在保留宿主特异性的同时重塑了家犬肠道微生物组
Arya Gautam， Dinesh Bhandari， Kusha Gurung， Aashish Gyawali， Kshitiz Gurung， Pratiksha Yadav， Kyle C.M. Smith， Anique Ahmad， Deena Shrestha， Kimberly Ange-van Heugten， Laura Weyrich， Ajit K Karna， Aashish Jha
bioRxiv 2026.06.29.735155； doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.29.735155
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.29.735155v1?rss=1
🏷️ 家犬肠道微生物组 工业化影响 16S rRNA测序 宿主特异性 跨物种比较