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背景：长链非编码RNA（lncRNA）表现出快速的进化更替，这一过程通常由基因组复制驱动。旁系同源lncRNA如何在不同的基因组环境中维持、分配或分化其功能，仍然知之甚少。进化上保守的lncRNA MORRBID及其灵长类特异性的旁系同源物CYTOR，为探究lncRNA复制的功能后果提供了一个天然框架。 结果：尽管CYTOR和MORRBID受其分化的基因组环境影响，已获得不同的转录本变体，我们证明它们仍然保留了一种稳健的共享核心功能，该功能由近乎相同的优势性双外显子转录本所编码。利用基于SNP的旁系同源物特异性定量分析，我们发现CYTOR对共享转录本池的贡献更为显著，而两种转录本均主要定位于细胞质，这与共享的反式作用功能一致。对CYTOR和MORRBID进行同步抑制，在多种癌症模型中均一致性地削弱了细胞黏附和迁移能力。在机制上，共享的CYTOR/MORRBID转录本池与MEK2相关联，并维持MEK-ERK信号传导。该信号轴促进FOSL1表达以及AP-1相关的转录输出，包括下游效应因子EPHA4的表达，而其作用得到了回复实验的支持。患者肿瘤转录组和健康单细胞数据集进一步支持了与之相关的间充质、黏附以及上皮-间质转化程序。 结论：我们的研究结果表明，旁系同源lncRNA尽管发生了依赖于环境背景的转录分化，仍可保留保守的机制核心。CYTOR/MORRBID转录本池界定了一个共享的lncRNA信号模块，在癌症和间充质样细胞环境中支持MAPK-ERK信号传导以及黏附-迁移程序。这为这些被广泛研究的旁系同源lncRNA所共享的核心功能提供了统一的机制框架。
背景：长链非编码RNA（lncRNA）表现出快速的进化更替，而这一过程常常由基因组复制所驱动。旁系同源lncRNA如何在不同基因组背景下维持、分担或分化其功能，仍然知之甚少。进化上保守的lncRNA MORRBID及其灵长类特异性的旁系同源基因CYTOR，为探究lncRNA复制所带来的功能后果提供了一个天然框架。
结果：尽管CYTOR和MORRBID在其分化的基因组环境影响下获得了不同的转录本变体，我们证明它们仍然保留了一个稳健的、共享的核心功能，该功能由近乎相同的优势双外显子转录本编码。利用基于SNP的旁系同源特异性定量，我们发现CYTOR对共享转录本库的贡献更强，而这两种转录本均主要定位于细胞质，这与其共享的反式作用功能相一致。在多种癌症模型中，同时抑制CYTOR和MORRBID均可稳定地损害细胞黏附和迁移能力。在机制上，共享的CYTOR/MORRBID转录本库与MEK2相关联，并维持MEK-ERK信号传导。该信号轴促进FOSL1表达及AP-1相关的转录输出，包括下游效应因子EPHA4的表达，而其作用也得到了挽救实验的支持。患者肿瘤转录组和健康单细胞数据集进一步支持了与之相关的间质样、黏附性以及上皮-间质转化程序。
结论：我们的研究结果确立了这样一种观点：尽管存在依赖背景的转录分化，旁系同源lncRNA仍可保留一个保守的机制核心。CYTOR/MORRBID转录本库界定了一个共享的lncRNA信号模块，该模块在癌症及间质样细胞背景中支持MAPK-ERK信号传导以及黏附-迁移程序。这为这些被广泛研究的旁系同源lncRNA所共享的核心功能提供了一个统一的机制框架。
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.24.734157v1?rss=1
🏷️ 长链非编码RNA 旁系同源基因 MEK-ERK信号通路 细胞黏附与迁移 癌症转录调控