整合RNA测序再分析揭示特发性肺纤维化中可重复的基质-免疫特征签名

在特发性肺纤维化（IPF）中，肺通过协调的上皮、基质及免疫相关程序发生重塑，但单个转录组队列的样本量通常过小，难以将共享的疾病信号与人口统计学因素及研究层面的变异区分开来。为在保留研究感知型解释的同时提高统计效能，我们整合了来自五项注释完善研究的原始肺组织 bulk RNA 测序（RNA-seq）数据，并在一个统一框架下对223份样本进行了分析，该框架对性别、年龄、文库布局以及重复采样进行了建模。IPF表现出广泛且可重复的表达变化，其中有2,443个基因达到差异表达阈值：假发现率（FDR）

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整合RNA测序重分析揭示特发性肺纤维化中可重复的基质-免疫特征

Sneha Nandimandalam， 查看 ORCID 个人资料 Jin He， 查看 ORCID 个人资料 George I. Mias

doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.24.734263

Sneha Nandimandalam 1 密歇根州立大学； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY-NC 4.0 国际许可协议 提供。

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整合RNA测序重分析揭示特发性肺纤维化中可重复的基质-免疫特征

Sneha Nandimandalam， Jin He， George I. Mias

bioRxiv 2026.06.24.734263； doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.24.734263

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整合RNA测序重分析揭示特发性肺纤维化中可重复的基质-免疫特征

Sneha Nandimandalam， Jin He， George I. Mias

bioRxiv 2026.06.24.734263； doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.24.734263

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📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.24.734263v1?rss=1

🏷️ 特发性肺纤维化 RNA测序整合分析 差异表达分析 基质-免疫特征 弹性网络分类