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人口统计学因素对于评估物种灭绝风险具有内在的重要性。然而，对这些因素进行测量仍然困难且耗时，因此人们主张使用基因组汇总统计量来评估物种的保护状况。在本研究中，我们利用群体基因组测序数据，对101种植物的以下指标进行了估算：（i）普查种群数量（Nc）；（ii）三个不同时期的有效种群大小（Ne），即近期、历史时期和远古时期；（iii）中性遗传多样性（{pi}4）；以及（iv）纯化选择效力的度量指标（{pi}0/{pi}4）。其中，21个物种来自中国西南地区“极小种群野生植物物种”项目（PSESP）。 受威胁物种表现出显著更低的Ne、Nc、{pi}4以及更弱的纯化选择，但其Ne/Nc比值高于非受威胁物种。Nc是判定保护状况的主要决定因素，而当代中性遗传多样性则主要受历史Ne的影响。在缺乏人口统计学信息的情况下，遗传参数是保护状况的良好替代指标，这很可能是因为当前受威胁物种在历史上也具有较低的种群大小。 总之，我们的研究结果表明，Nc的直接估算比{pi}4更有用，尽管后者仍然是一个有价值的保护指标。因此，诸如PSESP之类的工作应当得到进一步推广。
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近期与历史种群统计史对植物物种基因组多样性和保护状态的贡献
TongZhou Tao， Pan Li， Yuxiang Zhu， Sining Zhang， Mingming Zhang， Martin Lascoux， Jun Chen
doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.24.734111
TongZhou Tao 1 浙江大学； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY 4.0 国际许可协议公开提供。
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发布于 2026 年 6 月 29 日。 下载 PDF 补充材料 数据/代码 电子邮件
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近期与历史种群统计史对植物物种基因组多样性和保护状态的贡献
TongZhou Tao， Pan Li， Yuxiang Zhu， Sining Zhang， Mingming Zhang， Martin Lascoux， Jun Chen
bioRxiv 2026.06.24.734111； doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.24.734111
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TongZhou Tao， Pan Li， Yuxiang Zhu， Sining Zhang， Mingming Zhang， Martin Lascoux， Jun Chen
bioRxiv 2026.06.24.734111； doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.24.734111
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.24.734111v1?rss=1
🏷️ 植物保护 种群基因组学 有效种群大小 遗传多样性 灭绝风险评估