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从稀疏采样的二维组织切片重建三维分子体积，受限于每张切片的标记物缺失和组织丢失。我们提出了 3D-Omics-Flow，这是一种生成式流程，能够在单细胞分辨率下联合修复受损切片并对切片之间进行插值。在涵盖健康与疾病的数据集中，3D-Omics-Flow 将三维空间蛋白质组学扩展到切实可行的采样条件，使得能够基于不完美的二维切片堆栈进行图谱构建和下游分析。
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摘要 从稀疏采样的二维组织切片重建三维分子体积，受到每张切片标记物缺失和组织丢失的限制。我们提出了 3D-Omics-Flow，这是一条生成式流程，能够以单细胞分辨率联合修复受损切片并在切片之间进行插值。在涵盖健康与疾病状态的数据集中，3D-Omics-Flow 将三维空间蛋白质组学扩展到具有实际可行性的采样条件，从而能够基于不完美的二维切片堆栈进行图谱构建和下游分析。
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发表于 2026 年 6 月 28 日。 下载 PDF 补充材料 电子邮件
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Zhaojun Zhang ， Yuqi Tan ， Garry Nolan ， Michael Snyder ， Zongming Ma
bioRxiv 2026.06.23.733649； doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.23.733649
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Zhaojun Zhang ， Yuqi Tan ， Garry Nolan ， Michael Snyder ， Zongming Ma
bioRxiv 2026.06.23.733649； doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.23.733649
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.23.733649v1?rss=1
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