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欧洲平牡蛎（Ostrea edulis）与许多其他牡蛎物种一样，数千年来一直遭受开发利用，并且在数个世纪以来持续被养殖和迁移转运。鉴于其种群曾经历严重衰退，并结合当前正在推进的保护与恢复项目，现今必须重视遗传学因素，以避免决策失误。 本研究的目标是补充此前沿欧洲海岸不同空间尺度开展的群体遗传学研究。我们的采样主要针对法国大西洋沿岸、英吉利海峡沿岸以及地中海沿岸，旨在对这些区域内的种群进行精细尺度的遗传特征分析。通过整合 SNP 芯片与低覆盖度测序数据集，我们获得了欧洲西部范围内欧洲平牡蛎群体遗传结构的全面概览。此前在西欧识别出的多数遗传簇均得到了证实。在法国，被归入这些遗传簇的种群表现出显著的斑块内同质性。然而，本研究揭示了两项关键发现：（1）大西洋遗传簇与地中海西部遗传簇之间存在一个广泛的重叠区，其范围至少从葡萄牙南部延伸至法国南部；（2）在英吉利海峡以东检测到一个新发现的、界限清晰且显著不同的隐匿遗传簇，但其地理分布范围仍有待进一步界定。这些发现对于指导管理决策至关重要，尤其是在该物种分布范围内保护与恢复计划正在实施的背景下。
北法国一个隐匿的局部遗传簇：通过整合 SNP 阵列与全基因组测序揭示欧洲平牡蛎谱系的镶嵌格局 | bioRxiv
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北法国一个隐匿的局部遗传簇：通过整合 SNP 阵列与全基因组测序揭示欧洲平牡蛎谱系的镶嵌格局
Sylvie Lapegue， Florence Cornette， Serge Heurtebise， Stephane Pouvreau， Cynthia Carpentier， Lila Colston-Nepali， Nicolas Bierne， Celine Reisser
doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.26.734753
Sylvie Lapegue 1 Ifremer； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 该作品依据 CC-BY 4.0 国际许可协议 提供。
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发表于 2026 年 6 月 28 日。
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Sylvie Lapegue， Florence Cornette， Serge Heurtebise， Stephane Pouvreau， Cynthia Carpentier， Lila Colston-Nepali， Nicolas Bierne， Celine Reisser
bioRxiv 2026.06.26.734753； doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.26.734753
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北法国一个隐匿的局部遗传簇：通过整合 SNP 阵列与全基因组测序揭示欧洲平牡蛎谱系的镶嵌格局
Sylvie Lapegue， Florence Cornette， Serge Heurtebise， Stephane Pouvreau， Cynthia Carpentier， Lila Colston-Nepali， Nicolas Bierne， Celine Reisser
bioRxiv 2026.06.26.734753； doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.26.734753
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.26.734753v1?rss=1
🏷️ 群体遗传学 遗传结构 SNP芯片 全基因组测序 欧洲扁牡蛎 保护遗传学