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HIV储存库在个体之间具有异质性，但导致这种变异性的宿主决定因素仍不清楚。对1,230名HIV感染者应用多组学聚类分析，整合循环免疫细胞的组学与功能数据（转录组学、DNA甲基化、免疫表型分析、离体细胞因子产生能力）、血浆蛋白质组学以及CD4+ T细胞储存库测量数据（总HIV-DNA和完整HIV-DNA拷贝数），揭示了三种免疫学上不同的内表型：All Low（总储存库低/完整储存库低）、All High（总储存库高/完整储存库高）和Mixed（总储存库高/完整储存库低）。在每种内表型中，单层分析均观察到不同的免疫图谱，同时其临床特征也存在差异。通过跨所有数据层应用非线性机器学习，研究发现了线性单层方法未能捕捉到的关键预测因子，显示IFN-γ产生与TCF7/AK5表达，以及IL-1β/MCP-1产生与MAN1C1/EDAR表达，分别与完整储存库大小和总储存库大小相关。这一宿主-病毒整合多组学框架提供了系统层面的资源，或有助于为以实现HIV治愈和/或减少合并症为目标的储存库缩减干预研究提供个体化支持。
多组学聚类区分总 HIV 储存库与完整 HIV 储存库及相关宿主免疫机制 | bioRxiv
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多组学聚类区分总 HIV 储存库与完整 HIV 储存库及相关宿主免疫机制
Victoria Rios-Vazquez，Mareva Delporte，Twan Otten，Vasiliki Matzaraki，Wilhelm A.J.W. Vos，Marc Blaauw，Louise E. van Eekeren，Albert E. Groenendijk，Rainer Knoll，Anna C. Aschenbrenner，Rob J.W. Arts，Jéssica C. dos Santos，Adriana Navas，Sarah Gerlo，Jan van Lunzen，Leo A.B. Joosten，Mihai G. Netea，André J.A.M. van der Ven，Linos Vandekerckhove
doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.24.734029
Victoria Rios-Vazquez 1 拉德堡德大学医学中心； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授权 bioRxiv 永久展示该预印本。 保留所有权利。未经许可不得转载。
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发表于 2026 年 6 月 26 日。
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Victoria Rios-Vazquez，Mareva Delporte，Twan Otten，Vasiliki Matzaraki，Wilhelm A.J.W. Vos，Marc Blaauw，Louise E. van Eekeren，Albert E. Groenendijk，Rainer Knoll，Anna C. Aschenbrenner，Rob J.W. Arts，Jéssica C. dos Santos，Adriana Navas，Sarah Gerlo，Jan van Lunzen，Leo A.B. Joosten，Mihai G. Netea，André J.A.M. van der Ven，Linos Vandekerckhove
bioRxiv 2026.06.24.734029； doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.24.734029
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多组学聚类区分总 HIV 储存库与完整 HIV 储存库及相关宿主免疫机制
Victoria Rios-Vazquez，Mareva Delporte，Twan Otten，Vasiliki Matzaraki，Wilhelm A.J.W. Vos，Marc Blaauw，Louise E. van Eekeren，Albert E. Groenendijk，Rainer Knoll，Anna C. Aschenbrenner，Rob J.W. Arts，Jéssica C. dos Santos，Adriana Navas，Sarah Gerlo，Jan van Lunzen，Leo A.B. Joosten，Mihai G. Netea，André J.A.M. van der Ven，Linos Vandekerckhove
bioRxiv 2026.06.24.734029； doi： https://doi.org/10.64898/2026.06.24.734029
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.24.734029v1?rss=1
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