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由于木霉属物种能够寄生植物病原真菌，因此被广泛用作生物防治因子。然而，即使在同一物种内，不同菌株之间的菌寄生表现也存在显著差异，而其潜在的分子机制仍知之甚少。在本研究中，我们对六株哈茨木霉近缘种 Trichoderma atroviride 菌株进行了比较基因组学和转录组学分析，这些菌株在针对芸薹链格孢（Alternaria brassicicola）、立枯丝核菌（Rhizoctonia solani）和终极腐霉近缘种（Globisporangium ultimum）时表现出截然不同的菌寄生能力（弱寄生或强寄生；WP 或 HP）。 比较基因组学分析显示，菌株特异性差异较为有限，主要局限于 NLR（NOD 样受体）库；与 HP 菌株相比，WP 菌株基因组中缺失某些编码 NLR 的基因，而总体基因组变异水平仍然较低。相较之下，转录组分析揭示了 HP 与 WP 菌株在基因表达动态方面存在显著差异。共表达网络分析鉴定出两个与菌寄生表现相关的模块。第一个模块在响应病原物接触时被特异性诱导，富集了编码细胞壁降解酶的基因，并且在 HP 菌株中的表达更强。第二个模块则在所有条件下均在 HP 菌株中表现出更广泛的高表达，其中包含参与解毒和防御相关通路的基因。此外，该模块还包括参与特化代谢物生物合成和效应子样蛋白分泌的基因；在这些类别中，WP 与 HP 菌株差异性表达了不同的基因子集。 综上，这些结果为鉴定 T. atroviride 菌寄生表现的分子驱动因子提供了一个全面的研究框架。本研究加深了我们对该物种内部功能多样性的理解，并为未来开发用于预测菌株效能的分子标记奠定了坚实基础。
菌寄生性能的分子基础：对比性哈茨木霉菌株的基因组与转录组比较 | bioRxiv
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对比性哈茨木霉菌株菌寄生性能的分子基础：基因组与转录组比较
Etienne Brémand，
Franck Bastide，
Justine Colou，
Nicolas Denancé，
Séverine Boisard，
Nicolas Ruiz，
Samuel Bertrand，
Muriel Marchi，
Jérôme Verdier，
Thomas Guillemette
doi：
https://doi.org/10.64898/2026.06.22.733667
Etienne Brémand 1 昂热大学、法国国家农业食品与环境研究院（INRAE）、农业学院、UMR 1345 IRHS、SFR 4207 QUASAV，法国昂热；
Franck Bastide 1 昂热大学、法国国家农业食品与环境研究院（INRAE）、农业学院、UMR 1345 IRHS、SFR 4207 QUASAV，法国昂热；
Justine Colou 1 昂热大学、法国国家农业食品与环境研究院（INRAE）、农业学院、UMR 1345 IRHS、SFR 4207 QUASAV，法国昂热；
Nicolas Denancé 2 GEVES，SNES，病理学实验室，法国昂热；
Séverine Boisard 3 昂热大学，SONAS，SFR 4207 QUASAV，法国昂热；
Nicolas Ruiz 4 南特大学，UR 2160 ISOMer，法国南特
Samuel Bertrand 4 南特大学，UR 2160 ISOMer，法国南特
Muriel Marchi 1 昂热大学、法国国家农业食品与环境研究院（INRAE）、农业学院、UMR 1345 IRHS、SFR 4207 QUASAV，法国昂热；
Jérôme Verdier 1 昂热大学、法国国家农业食品与环境研究院（INRAE）、农业学院、UMR 1345 IRHS、SFR 4207 QUASAV，法国昂热；
Thomas Guillemette 1 昂热大学、法国国家农业食品与环境研究院（INRAE）、农业学院、UMR 1345 IRHS、SFR 4207 QUASAV，法国昂热；
通讯作者：
thomas.guillemette{at}univ-angers.fr
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摘要
由于能够寄生植物病原菌，木霉属（Trichoderma）物种被广泛用作生物防治因子。然而，不同菌株之间——甚至同一物种内部——在菌寄生性能上存在显著差异，而其潜在的分子机制仍知之甚少。在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。
本文依据 CC-BY-NC 4.0 国际许可协议公开提供。
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发表于 2026 年 6 月 26 日。
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Etienne Brémand，
Franck Bastide，
Justine Colou，
Nicolas Denancé，
Séverine Boisard，
Nicolas Ruiz，
Samuel Bertrand，
Muriel Marchi，
Jérôme Verdier，
Thomas Guillemette
bioRxiv
2026.06.22.733667；
doi：
https://doi.org/10.64898/2026.06.22.733667
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对比性哈茨木霉菌株菌寄生性能的分子基础：基因组与转录组比较
Etienne Brémand，
Franck Bastide，
Justine Colou，
Nicolas Denancé，
Séverine Boisard，
Nicolas Ruiz，
Samuel Bertrand，
Muriel Marchi，
Jérôme Verdier，
Thomas Guillemette
bioRxiv
2026.06.22.733667；
doi：
https://doi.org/10.64898/2026.06.22.733667
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.22.733667v1?rss=1
🏷️ 木霉菌 菌寄生 比较基因组学 转录组学 NLR受体 生物防治