人单核细胞来源的分化与极化条件下，纵向蛋白质组模块配置存在差异

单核细胞是关键的先天免疫细胞，能够分化为巨噬细胞和树突状细胞，或响应微环境信号而呈现不同的极化状态。尽管转录组学已取得进展，但支撑这些分化与极化轨迹的蛋白质组学图景仍未得到充分表征。 在本研究中，我们利用公开可获得的质谱数据集，对多种极化条件下的人单核细胞来源巨噬细胞和树突状细胞进行了纵向蛋白质组学分析。我们应用加权蛋白共表达网络分析（WPCNA）来识别蛋白质组模块，并刻画其在分化和极化条件下的时间动态变化。 结果表明，蛋白质组模块的构型具有条件特异性，并呈现出不同的纵向变化轨迹；其中富集的模块涉及免疫信号传导、代谢重编程以及细胞骨架重塑等通路。这些模块中的枢纽蛋白代表了可能调控单核细胞命运决定的潜在调控节点。 这些发现从系统层面揭示了单核细胞蛋白质组的组织方式，并凸显了在分化与极化过程中支撑功能特化的分子程序的分化性。

单核细胞是关键的先天免疫细胞，能够分化为巨噬细胞和树突状细胞，或在微环境信号的作用下采取不同的极化状态。尽管转录组学已取得进展，但支撑这些分化与极化轨迹的蛋白质组学图景仍未得到充分表征。在本研究中，我们利用公开可获得的质谱数据集，对多种极化条件下的人单核细胞来源巨噬细胞和树突状细胞进行了纵向蛋白质组学分析。我们采用加权蛋白共表达网络分析（WPCNA）来识别蛋白质组模块，并刻画其在分化和极化条件下的时间动态。结果显示，蛋白质组模块的构型具有条件特异性，并呈现出不同的纵向变化轨迹；这些模块富集于免疫信号传导、代谢重编程和细胞骨架重塑相关通路。上述模块中的枢纽蛋白代表了可能调控单核细胞命运决定的潜在调节节点。这些发现从系统层面揭示了单核细胞蛋白质组的组织方式，并强调了在分化与极化过程中支撑功能特化的分化性分子程序。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.24.734366v1?rss=1

🏷️ 单核细胞 巨噬细胞极化 树突状细胞分化 纵向蛋白质组学 加权共表达网络分析 免疫信号传导