MYC和RNA聚合酶II在转录终止位点附近的结合调控功能相关基因的表达

MYC致癌蛋白在启动子和增强子上的结合会影响由RNA聚合酶II（RNAPII）驱动的基因表达。许多基因还在其转录终止位点（TES）附近结合MYC。这通常通过环化使启动子与TES发生直接接触，并进一步调控总转录以及超出标准终止位点延伸的“读穿”转录。我们的目标是更清晰地阐明在人和小鼠细胞中，与TES相关的MYC和/或RNAPII结合串扰所遵循的规律。利用来自ENCODE门户及其他来源的ChIP-seq和RNA-seq数据集，我们发现MYC和RNAPII在TES和转录起始位点（TSS）周围的结合谱存在差异。E-box侧翼序列的变化可能解释了MYC对TES相关位点亲和力略低的原因。我们还观察到许多其他转录因子的基序也以非随机方式聚集，并且与MYC和RNAPII结合位点峰顶彼此邻近。平均而言，具有TES近端MYC或RNAPII位点的基因比不具有这些位点的基因表达更高，尽管共结合往往表现出抑制作用。正常和肿瘤性增殖刺激都会改变许多基因的MYC和RNAPII结合模式，这表明“类别转换”很常见，受不同外部信号影响且往往可逆。在功能上相关且具有高水平读穿转录的基因集上，均一致地标记有显著数量的TES相关MYC和/或RNAPII结合。这些发现表明，MYC和RNAPII在TES附近的结合无论是独立还是协同发生，都会动态影响总转录和读穿转录，同时协调许多具有共同功能基因集的表达。

MYC致癌蛋白在启动子和增强子上的结合会影响由RNA聚合酶II（RNAPII）驱动的基因表达。许多基因还在其转录终止位点（TES）附近结合MYC。这通常通过环化作用实现启动子与TES之间的直接接触，并进一步调控总转录以及超出标准终止位点延伸的“读穿”转录。我们在此旨在更清楚地阐明在人类和小鼠细胞中，与TES相关的MYC和/或RNAPII结合串扰所遵循的规则。利用来自ENCODE门户及其他来源的ChIP-seq和RNA-seq数据集，我们发现MYC和RNAPII在TES和转录起始位点（TSS）周围的结合谱存在差异。E-box侧翼序列的变化可能解释了MYC对TES相关位点亲和力略低的原因。我们还观察到，许多其他转录因子的基序也以非随机方式聚集，并且与MYC和RNAPII结合位点峰顶彼此紧密邻近。平均而言，具有TES邻近MYC或RNAPII位点的基因比较不具有这些位点的基因表达更高，尽管共结合往往表现出抑制作用。正常和肿瘤性增殖刺激都会改变许多基因的MYC和RNAPII结合模式，表明“类别转换”很常见，受不同外部信号调控且通常可逆。在功能上相关、具有高水平读穿转录的基因集上，均一致地标记有显著数量的TES相关MYC和/或RNAPII结合。这些发现表明，无论是独立作用还是协同作用，TES附近的MYC和RNAPII结合都会动态影响总转录和读穿转录，同时还协调许多具有共同功能基因集的表达。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.22.733817v1?rss=1

🏷️ Myc RNA聚合酶II 转录终止位点 读穿转录 基因表达调控 ChIP-seq