三个质粒策略，一个中间趋同状态：印度优势碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌克隆中特异谱系的耐药性与毒力架构

摘要 卡巴培南耐药肺炎克雷伯菌（CRKp）是由获得高毒力基因的高风险多重耐药（MDR）克隆驱动的、对全球医疗保健构成严重威胁的病原体。尽管耐药性与毒力并存的现象已有大量报道，但促成二者汇聚的质粒层面机制仍不清楚。在本研究中，我们结合短读长与长读长混合全基因组测序，对376株临床CRKp菌株进行了分析，以界定三种占优势的高风险克隆——ST147（n=157）、ST231（n=108）和ST2096（n=111）——的进化轨迹及结构性质粒动态。90%的分离株携带碳青霉烯酶基因，且主要为blaOXA-48-like和blaNDM-5，并与blaCTX-M-15共携带。毒力谱分析显示，aerobactin（iuc）高流行（62.7%），而salmochelin和colibactin未检出。高黏液表型发生率较低（6.6%），且与rmpA/rmpA2无关，证实基因型与表型之间存在明显不一致。比较质粒绘图揭示了支撑这一中间型汇聚病原型的三种不同、谱系特异性质粒构型：ST147表现为动态、嵌合式的IncFIB-IncHI1B杂合质粒；ST2096表现为结构稳定的杂合质粒；而ST231则将毒力与耐药决定因素保留在彼此分离的质粒上。这些发现表明，汇聚由多条克隆特异性的进化路径共同调控，而非单一路径所致，凸显了开展更深入基因组监测的迫切必要性，该监测应能够同时识别汇聚性质粒和高风险谱系。

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🏷️ 碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌 质粒汇聚 高风险克隆 毒力-耐药共存 全基因组测序