参考引导的免疫恢复匹配优先考虑中药成分

从单细胞转录组出发进行治疗优先级排序，需要一个比疾病特征逆转更接近治疗反应的靶标。在免疫性疾病中，治疗后的恢复过程可能遵循患者特异性和细胞类型特异性的轨迹，而不是沿着治疗前疾病轴线简单回归。 我们开发了 ImmuneNavi，这是一种以健康参考为锚定、基于恢复匹配的工作流程，用于利用配对 PBMC 数据对中药成分进行排序。该流程将异质性的 PBMC 队列映射到统一的健康免疫坐标系统，构建患者—细胞类型层面的疾病状态与恢复状态，并将 ITCM 处理—对照谱加工为固定的成分扰动库。患者状态与成分状态在匹配的基因、通路和转录因子视角下进行表征，使模型能够结合局部转录方向与更稳定的程序层面特征。 在一个配对治疗队列上训练得到的匹配器，在无需重新定义特征空间、候选集合或预处理流程的情况下，能够在独立的 PBMC 队列中保持与恢复一致的成分排序结果。这为从配对免疫状态测量出发，推进到可供实验后续验证的天然产物候选物优先级排序，提供了一条可复用的转录组学流程。

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🏷️ 单细胞转录组 PBMC 免疫恢复 中药成分筛选 治疗优先级排序 配对队列分析