人类小梁网与睫状体的整合多组学细胞图谱

root 提交于 周二, 06/23/2026 - 14:47
小梁网(TM)和睫状体(CB)调控房水动力学及眼压(IOP),而TM/Schlemm 管(SC)功能障碍是青光眼发生的基础。在此,我们构建了人类TM和CB的空间分辨多组学图谱,整合了来自112名供体、超过一百万个细胞和细胞核的snRNA-seq、scRNA-seq和snATAC-seq数据,以及Xenium空间转录组学数据。我们鉴定出9类主要细胞类别和21种细胞类型,揭示了细胞异质性,包括表征不足的成纤维细胞和上皮细胞亚群。空间定位分析支持TM成纤维细胞的分区特征以及CB上皮的组织结构。调控分析鉴定出细胞类型特异性的调控程序,包括CB上皮中的OTX/PAX网络以及成纤维细胞中的SMAD3/TGF-β信号通路。与青光眼相关位点的整合分析表明,与原发性开角型青光眼(POAG)和原发性闭角型青光眼(PACG)相关的调控元件中富集了非编码变异。与年龄和祖源相关的重塑揭示了成纤维细胞衰老的分化趋势,并伴随PIEZO1表达升高,提示房水流出受损和眼压升高。总体而言,这一高分辨率图谱将细胞、调控和遗传变异与前节功能及青光眼易感性联系起来。

ruic20{at}hs.uci.edu

摘要

小梁网(TM)和睫状体(CB)调控房水动力学和眼压(IOP),而 TM/Schlemm 管(SC)功能障碍是青光眼的基础病理机制。在此,我们构建了人类 TM 和 CB 的空间分辨多组学图谱,整合了来自 112 位供体、超过一百万个细胞和细胞核的单核 RNA 测序(snRNA-seq)、单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)和单核 ATAC 测序(snATAC-seq)数据,并结合 Xenium 空间转录组学。我们鉴定出 9 种主要细胞类别和 21 种细胞类型,揭示了其异质性,包括表征不足的成纤维细胞和上皮细胞亚群。空间定位结果支持 TM 成纤维细胞的分区特征以及 CB 上皮的组织结构。调控分析鉴定出细胞类型特异性的调控程序,包括 CB 上皮中的 OTX/PAX 网络以及成纤维细胞中的 SMAD3/TGF-β 信号通路。与青光眼相关位点整合分析显示,非编码变异富集于与原发性开角型青光眼(POAG)和原发性闭角型青光眼(PACG)相关的调控元件中。与年龄和祖源相关的重塑揭示了成纤维细胞衰老的分化模式,并伴随 PIEZO1 表达增加,提示房水流出受损和眼压升高。总体而言,这一高分辨率图谱将细胞、调控及遗传变异与前节功能及青光眼易感性联系起来。

利益冲突声明

已声明的资助信息

陈—扎克伯格倡议(美国) 2019-002425 2021-239847

美国国家眼科研究所 https://ror.org/03wkg3b53 EY022359 EY028608 EY025643 EY032507 EY034070

美国国立卫生研究院 https://ror.org/01cwqze88 S10OD023469

版权

持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本作品依据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议 公开提供。

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发布于 2026 年 6 月 22 日。

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人类小梁网与睫状体的整合多组学细胞图谱

Jinjing Jian, Xuan Bao, Jun Wang, Ye Zheng, Jin Li, Jianming Shao, Tingting Yang, Ismail Yaman, Jean Li, Han Chen, Nicholas Tolman, Richard H. Scheuermann, Jie J. Zheng, Carl Sheridan, Yutao Liu, Yiqin Du, Revathi Balasubramanian, Gulab S. Zode, Simon John, J Timothy Stout, Dan Stamer, Yumei Li, Rui Chen

bioRxiv 2026.06.17.732980; doi: https://doi.org/10.64898/2026.06.17.732980

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Jinjing Jian, Xuan Bao, Jun Wang, Ye Zheng, Jin Li, Jianming Shao, Tingting Yang, Ismail Yaman, Jean Li, Han Chen, Nicholas Tolman, Richard H. Scheuermann, Jie J. Zheng, Carl Sheridan, Yutao Liu, Yiqin Du, Revathi Balasubramanian, Gulab S. Zode, Simon John, J Timothy Stout, Dan Stamer, Yumei Li, Rui Chen

bioRxiv 2026.06.17.732980; doi: https://doi.org/10.64898/2026.06.17.732980


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.06.17.732980v1?rss=1

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