遗传渐渗和转录组可塑性与增强的杜氏利什曼原虫致病性相关，并在突尼斯导致人类皮肤利什曼病

原生动物寄生虫婴儿利什曼原虫（Leishmania infantum）在不同分离株之间表现出显著的遗传变异性，这种变异会影响疾病表现和治疗反应。尽管L. infantum在经典定义上被认为是内脏利什曼病（Visceral Leishmaniasis, VL）的病原体——该疾病通常与免疫缺陷相关——但在不同国家中，已有关于该物种在免疫功能正常个体中引发皮肤利什曼病（Cutaneous Leishmaniasis, CL）的报道。为探究这种异常组织嗜性转变及致病性改变的分子基础，我们对突尼斯的两株犬源分离株（CanL）和两株与皮肤利什曼病相关的人源分离株（CL）采用了比较基因组学和转录组学研究方法。 尽管CanL分离株与L. infantum参考株（JPCM5）表现出较高的遗传相似性，但基于SNP的定位和频率分析，CL分离株形成了一个独立且高度分化的聚类，不仅不同于JPCM5，也彼此之间存在差异。通过利用宏基因组序列分类工具Kraken，我们揭示了CL分离株具有复杂的杂交性质，显示出来自L. donovani和L. tropica的基因渐渗，提示杂交在产生新的表型特征中发挥了关键作用。对RNA-seq和DNA-seq数据的整合分析表明，无论是在CanL组或CL组内部，还是在两组之间，只有少部分基因表达变异反映了由拷贝数变异所导致的基因剂量效应，而大多数表达差异独立于基因剂量，提示转录后调控机制参与了寄生虫的适应过程。 总之，本研究确定了杂交、基因组不稳定性和转录组适应是驱动L. infantum进化潜力的相互关联机制。这些机制可共同增强寄生虫适应性获益，并可能解释一种传统上与内脏感染相关的物种中皮肤型疾病表现的出现。

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