灵长类动物肠道细菌微生物组:研究方法、分类覆盖范围及其保护意义的系统综述

root 提交于 周二, 06/23/2026 - 18:47
灵长类动物在人类进化研究和生态系统功能中都处于核心地位,既充当种子传播者、捕食者、传粉者,也作为猎物存在。尽管灵长类动物对人类科学和生态系统科学具有重要价值,全球灵长类种群仍在持续下降,目前约有 65% 的物种受到灭绝威胁。保护生物学日益认识到,物种存续不仅依赖于栖息地和种群的保护,还取决于对支撑宿主健康、营养和恢复力的微生物群落的保护。肠道细菌微生物组在消化、免疫功能以及对环境变化的适应中发挥关键作用,因此成为灵长类保护中的一个重要维度。在此,我们系统且定量地评估了灵长类肠道细菌微生物组研究在分类学和地理学上的覆盖情况,以识别与灵长类保护相关的关键知识空白。2001 年至 2025 年间,共有 261 篇文章发表于 100 种期刊。尽管在科级层面的分类覆盖度较高,但在更精细的分类尺度上,这种覆盖度显著下降。目前,仅约 34.5% 的物种得到过研究,这意味着仍有 344 个物种的肠道细菌多样性尚未被记录。此外,大约三分之一已研究物种仅在圈养条件下被研究,这限制了对自然微生物组变异的认识,并削弱了这些研究结果与保护实践的相关性。地理偏倚进一步阻碍了保护应用,诸如巴西、刚果民主共和国和印度尼西亚等超级多样性国家的代表性不足。除此之外,研究方法和报告标准仍然缺乏一致性。为应对这些挑战,本综述纳入了一个关于灵长类肠道细菌微生物组研究中最小数据集标准化报告的框架。采用这一框架将提升透明度、可比性和数据可获取性,从而增强微生物组研究在灵长类保护中的应用价值。通过将微生物生态学整合进保护生物学,我们强调微生物组可能是保障灵长类健康、进化潜力和长期存续的一个关键前沿领域。

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