用于基于菌落的天然产物去重复鉴定的MALDI串联质谱法

微生物文库仍然是天然产物发现的重要资源；然而，构建在分类学和化学多样性方面均具有代表性的菌株集合仍然是一项挑战。去重策略的进展，包括分子网络分析，已经减少了已知生物活性分子的重复发现，并促进了新型化学骨架的鉴定，但这些方法通常是在文库构建之后或针对现有资源库应用的。此外，许多去重工作流程需要进行放大发酵和提取，从而增加了评估微生物代谢物谱所需的时间。在此，我们将基质辅助激光解吸/电离串联质谱（MALDI-MS/MS）整合到生物信息学平台 IDBac 中，从而实现对微生物分类学身份、代谢物产生潜力以及通过 GNPS2 分子网络进行初步代谢物注释的高效表征。这一微型化的高内涵工作流程通过在放大培养和提取之前，直接从单个微生物菌落获得代谢物注释，促进了菌株优先级筛选。将该方法应用于海洋放线菌后，成功注释了薰衣草氰菌素（lavanducyanin）和多种萘并吡喃霉素（napyradiomycin）类似物。随后开展的研究发现了来源于海洋链霉菌 Streptomyces sp. CNZ-289 的 napyradiomycin B8，并通过一维和二维核磁共振（1D 和 2D NMR）谱学以及 MALDI-MS/MS 对其进行了确认。将该工作流程进一步扩展至对 25 株来源于海洋脊椎动物共生菌的细菌分离株进行非靶向分析后，注释出了若干已知具有生物活性的天然产物，包括 surugamides、antimycins、去铁胺类载铁体（desferrioxamine siderophores），并利用 NMR 分离和解析了 harmane 衍生物。

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